Protein–RNA interactions for Protein: Q01780

EXOSC10, Exosome component 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC10Q01780 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EXOSC10Q01780 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EXOSC10Q01780 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EXOSC10Q01780 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EXOSC10Q01780 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EXOSC10Q01780 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EXOSC10Q01780 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EXOSC10Q01780 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EXOSC10Q01780 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EXOSC10Q01780 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EXOSC10Q01780 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EXOSC10Q01780 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
EXOSC10Q01780 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EXOSC10Q01780 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EXOSC10Q01780 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EXOSC10Q01780 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
EXOSC10Q01780 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EXOSC10Q01780 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EXOSC10Q01780 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EXOSC10Q01780 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EXOSC10Q01780 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EXOSC10Q01780 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
EXOSC10Q01780 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EXOSC10Q01780 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EXOSC10Q01780 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EXOSC10Q01780 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EXOSC10Q01780 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EXOSC10Q01780 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EXOSC10Q01780 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EXOSC10Q01780 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EXOSC10Q01780 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EXOSC10Q01780 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EXOSC10Q01780 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EXOSC10Q01780 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
EXOSC10Q01780 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EXOSC10Q01780 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EXOSC10Q01780 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
EXOSC10Q01780 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
EXOSC10Q01780 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EXOSC10Q01780 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EXOSC10Q01780 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EXOSC10Q01780 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EXOSC10Q01780 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EXOSC10Q01780 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EXOSC10Q01780 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EXOSC10Q01780 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EXOSC10Q01780 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EXOSC10Q01780 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EXOSC10Q01780 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EXOSC10Q01780 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EXOSC10Q01780 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EXOSC10Q01780 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EXOSC10Q01780 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EXOSC10Q01780 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EXOSC10Q01780 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EXOSC10Q01780 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EXOSC10Q01780 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EXOSC10Q01780 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EXOSC10Q01780 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EXOSC10Q01780 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EXOSC10Q01780 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EXOSC10Q01780 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EXOSC10Q01780 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EXOSC10Q01780 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EXOSC10Q01780 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EXOSC10Q01780 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EXOSC10Q01780 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EXOSC10Q01780 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EXOSC10Q01780 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EXOSC10Q01780 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EXOSC10Q01780 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EXOSC10Q01780 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EXOSC10Q01780 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EXOSC10Q01780 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
EXOSC10Q01780 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
EXOSC10Q01780 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EXOSC10Q01780 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
EXOSC10Q01780 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EXOSC10Q01780 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EXOSC10Q01780 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EXOSC10Q01780 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EXOSC10Q01780 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EXOSC10Q01780 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EXOSC10Q01780 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EXOSC10Q01780 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EXOSC10Q01780 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EXOSC10Q01780 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
EXOSC10Q01780 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EXOSC10Q01780 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EXOSC10Q01780 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EXOSC10Q01780 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EXOSC10Q01780 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EXOSC10Q01780 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EXOSC10Q01780 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EXOSC10Q01780 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EXOSC10Q01780 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EXOSC10Q01780 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EXOSC10Q01780 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EXOSC10Q01780 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EXOSC10Q01780 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms