Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MS4A2Q01362 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MS4A2Q01362 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MS4A2Q01362 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MS4A2Q01362 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MS4A2Q01362 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MS4A2Q01362 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MS4A2Q01362 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MS4A2Q01362 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MS4A2Q01362 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MS4A2Q01362 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MS4A2Q01362 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MS4A2Q01362 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MS4A2Q01362 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MS4A2Q01362 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MS4A2Q01362 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MS4A2Q01362 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MS4A2Q01362 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MS4A2Q01362 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MS4A2Q01362 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MS4A2Q01362 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MS4A2Q01362 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MS4A2Q01362 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MS4A2Q01362 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MS4A2Q01362 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MS4A2Q01362 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MS4A2Q01362 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MS4A2Q01362 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MS4A2Q01362 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MS4A2Q01362 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MS4A2Q01362 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MS4A2Q01362 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MS4A2Q01362 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MS4A2Q01362 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
MS4A2Q01362 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MS4A2Q01362 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MS4A2Q01362 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MS4A2Q01362 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MS4A2Q01362 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MS4A2Q01362 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MS4A2Q01362 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MS4A2Q01362 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MS4A2Q01362 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MS4A2Q01362 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MS4A2Q01362 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MS4A2Q01362 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MS4A2Q01362 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MS4A2Q01362 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MS4A2Q01362 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MS4A2Q01362 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MS4A2Q01362 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MS4A2Q01362 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MS4A2Q01362 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MS4A2Q01362 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MS4A2Q01362 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MS4A2Q01362 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MS4A2Q01362 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MS4A2Q01362 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MS4A2Q01362 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MS4A2Q01362 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MS4A2Q01362 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MS4A2Q01362 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MS4A2Q01362 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MS4A2Q01362 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MS4A2Q01362 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MS4A2Q01362 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MS4A2Q01362 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MS4A2Q01362 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
MS4A2Q01362 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MS4A2Q01362 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MS4A2Q01362 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MS4A2Q01362 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MS4A2Q01362 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MS4A2Q01362 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
MS4A2Q01362 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MS4A2Q01362 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MS4A2Q01362 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MS4A2Q01362 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MS4A2Q01362 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MS4A2Q01362 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MS4A2Q01362 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
MS4A2Q01362 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
MS4A2Q01362 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
MS4A2Q01362 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MS4A2Q01362 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MS4A2Q01362 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MS4A2Q01362 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MS4A2Q01362 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MS4A2Q01362 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MS4A2Q01362 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MS4A2Q01362 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MS4A2Q01362 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MS4A2Q01362 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MS4A2Q01362 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MS4A2Q01362 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MS4A2Q01362 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MS4A2Q01362 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MS4A2Q01362 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
MS4A2Q01362 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MS4A2Q01362 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.8 ms