Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
E2F1Q01094 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
E2F1Q01094 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
E2F1Q01094 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
E2F1Q01094 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
E2F1Q01094 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
E2F1Q01094 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
E2F1Q01094 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
E2F1Q01094 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
E2F1Q01094 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
E2F1Q01094 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
E2F1Q01094 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
E2F1Q01094 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
E2F1Q01094 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
E2F1Q01094 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
E2F1Q01094 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
E2F1Q01094 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
E2F1Q01094 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
E2F1Q01094 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
E2F1Q01094 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
E2F1Q01094 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
E2F1Q01094 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
E2F1Q01094 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
E2F1Q01094 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
E2F1Q01094 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
E2F1Q01094 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
E2F1Q01094 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
E2F1Q01094 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
E2F1Q01094 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
E2F1Q01094 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
E2F1Q01094 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
E2F1Q01094 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
E2F1Q01094 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
E2F1Q01094 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
E2F1Q01094 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
E2F1Q01094 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
E2F1Q01094 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
E2F1Q01094 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
E2F1Q01094 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
E2F1Q01094 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
E2F1Q01094 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
E2F1Q01094 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
E2F1Q01094 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
E2F1Q01094 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
E2F1Q01094 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
E2F1Q01094 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
E2F1Q01094 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
E2F1Q01094 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
E2F1Q01094 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
E2F1Q01094 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
E2F1Q01094 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
E2F1Q01094 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
E2F1Q01094 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
E2F1Q01094 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
E2F1Q01094 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
E2F1Q01094 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
E2F1Q01094 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
E2F1Q01094 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
E2F1Q01094 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
E2F1Q01094 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
E2F1Q01094 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
E2F1Q01094 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
E2F1Q01094 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
E2F1Q01094 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
E2F1Q01094 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
E2F1Q01094 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
E2F1Q01094 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
E2F1Q01094 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
E2F1Q01094 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
E2F1Q01094 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
E2F1Q01094 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
E2F1Q01094 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
E2F1Q01094 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
E2F1Q01094 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
E2F1Q01094 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
E2F1Q01094 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
E2F1Q01094 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
E2F1Q01094 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
E2F1Q01094 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
E2F1Q01094 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
E2F1Q01094 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
E2F1Q01094 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
E2F1Q01094 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
E2F1Q01094 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
E2F1Q01094 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
E2F1Q01094 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
E2F1Q01094 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
E2F1Q01094 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
E2F1Q01094 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
E2F1Q01094 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
E2F1Q01094 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
E2F1Q01094 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
E2F1Q01094 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
E2F1Q01094 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
E2F1Q01094 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
E2F1Q01094 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
E2F1Q01094 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
E2F1Q01094 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
E2F1Q01094 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
E2F1Q01094 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms