Protein–RNA interactions for Protein: Q00597

FANCC, Fanconi anemia group C protein, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCCQ00597 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FANCCQ00597 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FANCCQ00597 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FANCCQ00597 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FANCCQ00597 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FANCCQ00597 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FANCCQ00597 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FANCCQ00597 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FANCCQ00597 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FANCCQ00597 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FANCCQ00597 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FANCCQ00597 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FANCCQ00597 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FANCCQ00597 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FANCCQ00597 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FANCCQ00597 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FANCCQ00597 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FANCCQ00597 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FANCCQ00597 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FANCCQ00597 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FANCCQ00597 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FANCCQ00597 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FANCCQ00597 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FANCCQ00597 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FANCCQ00597 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FANCCQ00597 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FANCCQ00597 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FANCCQ00597 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FANCCQ00597 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FANCCQ00597 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FANCCQ00597 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FANCCQ00597 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FANCCQ00597 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FANCCQ00597 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FANCCQ00597 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FANCCQ00597 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FANCCQ00597 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FANCCQ00597 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FANCCQ00597 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FANCCQ00597 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FANCCQ00597 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FANCCQ00597 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FANCCQ00597 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FANCCQ00597 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FANCCQ00597 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FANCCQ00597 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FANCCQ00597 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FANCCQ00597 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FANCCQ00597 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FANCCQ00597 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FANCCQ00597 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FANCCQ00597 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FANCCQ00597 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FANCCQ00597 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FANCCQ00597 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FANCCQ00597 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FANCCQ00597 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
FANCCQ00597 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
FANCCQ00597 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FANCCQ00597 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FANCCQ00597 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FANCCQ00597 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FANCCQ00597 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FANCCQ00597 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FANCCQ00597 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FANCCQ00597 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FANCCQ00597 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FANCCQ00597 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FANCCQ00597 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
FANCCQ00597 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FANCCQ00597 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FANCCQ00597 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FANCCQ00597 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FANCCQ00597 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FANCCQ00597 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
FANCCQ00597 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FANCCQ00597 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FANCCQ00597 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FANCCQ00597 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FANCCQ00597 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FANCCQ00597 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FANCCQ00597 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FANCCQ00597 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FANCCQ00597 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FANCCQ00597 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FANCCQ00597 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FANCCQ00597 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FANCCQ00597 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FANCCQ00597 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FANCCQ00597 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FANCCQ00597 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FANCCQ00597 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FANCCQ00597 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FANCCQ00597 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FANCCQ00597 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FANCCQ00597 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FANCCQ00597 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FANCCQ00597 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FANCCQ00597 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FANCCQ00597 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms