Protein–RNA interactions for Protein: Q00537

CDK17, Cyclin-dependent kinase 17, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK17Q00537 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK17Q00537 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK17Q00537 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK17Q00537 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK17Q00537 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK17Q00537 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK17Q00537 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK17Q00537 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK17Q00537 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK17Q00537 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK17Q00537 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK17Q00537 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK17Q00537 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK17Q00537 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK17Q00537 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK17Q00537 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDK17Q00537 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDK17Q00537 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDK17Q00537 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDK17Q00537 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDK17Q00537 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDK17Q00537 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDK17Q00537 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDK17Q00537 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK17Q00537 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK17Q00537 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK17Q00537 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK17Q00537 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK17Q00537 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK17Q00537 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK17Q00537 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK17Q00537 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK17Q00537 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK17Q00537 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK17Q00537 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK17Q00537 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK17Q00537 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK17Q00537 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK17Q00537 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK17Q00537 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK17Q00537 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK17Q00537 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK17Q00537 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK17Q00537 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK17Q00537 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK17Q00537 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK17Q00537 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK17Q00537 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK17Q00537 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK17Q00537 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK17Q00537 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK17Q00537 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK17Q00537 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK17Q00537 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK17Q00537 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK17Q00537 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK17Q00537 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK17Q00537 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK17Q00537 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK17Q00537 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK17Q00537 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK17Q00537 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK17Q00537 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK17Q00537 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK17Q00537 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK17Q00537 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK17Q00537 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK17Q00537 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK17Q00537 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK17Q00537 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK17Q00537 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK17Q00537 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK17Q00537 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK17Q00537 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK17Q00537 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK17Q00537 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK17Q00537 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDK17Q00537 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDK17Q00537 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDK17Q00537 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDK17Q00537 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDK17Q00537 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDK17Q00537 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDK17Q00537 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDK17Q00537 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CDK17Q00537 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDK17Q00537 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDK17Q00537 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDK17Q00537 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDK17Q00537 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK17Q00537 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK17Q00537 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK17Q00537 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK17Q00537 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK17Q00537 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK17Q00537 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK17Q00537 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK17Q00537 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK17Q00537 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK17Q00537 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms