Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDK16Q00536 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDK16Q00536 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDK16Q00536 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDK16Q00536 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDK16Q00536 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDK16Q00536 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDK16Q00536 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDK16Q00536 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDK16Q00536 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDK16Q00536 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDK16Q00536 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDK16Q00536 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDK16Q00536 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CDK16Q00536 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDK16Q00536 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDK16Q00536 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDK16Q00536 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDK16Q00536 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CDK16Q00536 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
CDK16Q00536 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDK16Q00536 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDK16Q00536 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDK16Q00536 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDK16Q00536 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CDK16Q00536 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CDK16Q00536 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CDK16Q00536 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDK16Q00536 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDK16Q00536 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDK16Q00536 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDK16Q00536 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDK16Q00536 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDK16Q00536 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDK16Q00536 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CDK16Q00536 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CDK16Q00536 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CDK16Q00536 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CDK16Q00536 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CDK16Q00536 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CDK16Q00536 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CDK16Q00536 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CDK16Q00536 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CDK16Q00536 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
CDK16Q00536 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CDK16Q00536 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CDK16Q00536 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CDK16Q00536 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
CDK16Q00536 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CDK16Q00536 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CDK16Q00536 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CDK16Q00536 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CDK16Q00536 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CDK16Q00536 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CDK16Q00536 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CDK16Q00536 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CDK16Q00536 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CDK16Q00536 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CDK16Q00536 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CDK16Q00536 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CDK16Q00536 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CDK16Q00536 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CDK16Q00536 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CDK16Q00536 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CDK16Q00536 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CDK16Q00536 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CDK16Q00536 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CDK16Q00536 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CDK16Q00536 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CDK16Q00536 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CDK16Q00536 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CDK16Q00536 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CDK16Q00536 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CDK16Q00536 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CDK16Q00536 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CDK16Q00536 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CDK16Q00536 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CDK16Q00536 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CDK16Q00536 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CDK16Q00536 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CDK16Q00536 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CDK16Q00536 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CDK16Q00536 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CDK16Q00536 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CDK16Q00536 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CDK16Q00536 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CDK16Q00536 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CDK16Q00536 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CDK16Q00536 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CDK16Q00536 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CDK16Q00536 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CDK16Q00536 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CDK16Q00536 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CDK16Q00536 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CDK16Q00536 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CDK16Q00536 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CDK16Q00536 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CDK16Q00536 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CDK16Q00536 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CDK16Q00536 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms