Protein–RNA interactions for Protein: Q00534

CDK6, Cyclin-dependent kinase 6, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK6Q00534 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDK6Q00534 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDK6Q00534 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDK6Q00534 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDK6Q00534 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDK6Q00534 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDK6Q00534 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDK6Q00534 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDK6Q00534 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDK6Q00534 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDK6Q00534 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDK6Q00534 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CDK6Q00534 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDK6Q00534 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDK6Q00534 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDK6Q00534 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDK6Q00534 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDK6Q00534 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDK6Q00534 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDK6Q00534 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDK6Q00534 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDK6Q00534 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDK6Q00534 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDK6Q00534 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDK6Q00534 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDK6Q00534 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDK6Q00534 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDK6Q00534 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDK6Q00534 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDK6Q00534 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CDK6Q00534 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDK6Q00534 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDK6Q00534 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDK6Q00534 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDK6Q00534 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDK6Q00534 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDK6Q00534 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDK6Q00534 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDK6Q00534 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDK6Q00534 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDK6Q00534 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDK6Q00534 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDK6Q00534 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDK6Q00534 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDK6Q00534 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDK6Q00534 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDK6Q00534 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDK6Q00534 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDK6Q00534 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDK6Q00534 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDK6Q00534 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDK6Q00534 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDK6Q00534 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDK6Q00534 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDK6Q00534 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDK6Q00534 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDK6Q00534 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDK6Q00534 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDK6Q00534 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDK6Q00534 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDK6Q00534 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDK6Q00534 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDK6Q00534 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDK6Q00534 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDK6Q00534 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDK6Q00534 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDK6Q00534 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDK6Q00534 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CDK6Q00534 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDK6Q00534 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CDK6Q00534 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CDK6Q00534 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDK6Q00534 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDK6Q00534 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDK6Q00534 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDK6Q00534 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDK6Q00534 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDK6Q00534 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDK6Q00534 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDK6Q00534 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDK6Q00534 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDK6Q00534 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDK6Q00534 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDK6Q00534 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDK6Q00534 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDK6Q00534 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDK6Q00534 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CDK6Q00534 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CDK6Q00534 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CDK6Q00534 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CDK6Q00534 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDK6Q00534 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDK6Q00534 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDK6Q00534 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDK6Q00534 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDK6Q00534 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDK6Q00534 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDK6Q00534 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDK6Q00534 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDK6Q00534 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms