Protein–RNA interactions for Protein: P78412

IRX6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX6P78412 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
IRX6P78412 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
IRX6P78412 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
IRX6P78412 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
IRX6P78412 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
IRX6P78412 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
IRX6P78412 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
IRX6P78412 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
IRX6P78412 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
IRX6P78412 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
IRX6P78412 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
IRX6P78412 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
IRX6P78412 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
IRX6P78412 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
IRX6P78412 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
IRX6P78412 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
IRX6P78412 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
IRX6P78412 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
IRX6P78412 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
IRX6P78412 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
IRX6P78412 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
IRX6P78412 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
IRX6P78412 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
IRX6P78412 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
IRX6P78412 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
IRX6P78412 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
IRX6P78412 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
IRX6P78412 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
IRX6P78412 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
IRX6P78412 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
IRX6P78412 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
IRX6P78412 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
IRX6P78412 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
IRX6P78412 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
IRX6P78412 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
IRX6P78412 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
IRX6P78412 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
IRX6P78412 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
IRX6P78412 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
IRX6P78412 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
IRX6P78412 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
IRX6P78412 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
IRX6P78412 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
IRX6P78412 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
IRX6P78412 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
IRX6P78412 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
IRX6P78412 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
IRX6P78412 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
IRX6P78412 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
IRX6P78412 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
IRX6P78412 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
IRX6P78412 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
IRX6P78412 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
IRX6P78412 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
IRX6P78412 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
IRX6P78412 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
IRX6P78412 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
IRX6P78412 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
IRX6P78412 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
IRX6P78412 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
IRX6P78412 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
IRX6P78412 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
IRX6P78412 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
IRX6P78412 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
IRX6P78412 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
IRX6P78412 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
IRX6P78412 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
IRX6P78412 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
IRX6P78412 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
IRX6P78412 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
IRX6P78412 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
IRX6P78412 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
IRX6P78412 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
IRX6P78412 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
IRX6P78412 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
IRX6P78412 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
IRX6P78412 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
IRX6P78412 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
IRX6P78412 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
IRX6P78412 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
IRX6P78412 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
IRX6P78412 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
IRX6P78412 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
IRX6P78412 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
IRX6P78412 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
IRX6P78412 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
IRX6P78412 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
IRX6P78412 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
IRX6P78412 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
IRX6P78412 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
IRX6P78412 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
IRX6P78412 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
IRX6P78412 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
IRX6P78412 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
IRX6P78412 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
IRX6P78412 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
IRX6P78412 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
IRX6P78412 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
IRX6P78412 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
IRX6P78412 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms