Protein–RNA interactions for Protein: P78348

ASIC1, Acid-sensing ion channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC1P78348 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ASIC1P78348 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ASIC1P78348 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ASIC1P78348 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ASIC1P78348 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ASIC1P78348 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ASIC1P78348 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ASIC1P78348 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ASIC1P78348 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ASIC1P78348 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ASIC1P78348 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ASIC1P78348 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ASIC1P78348 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ASIC1P78348 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ASIC1P78348 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ASIC1P78348 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ASIC1P78348 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ASIC1P78348 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ASIC1P78348 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ASIC1P78348 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ASIC1P78348 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ASIC1P78348 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ASIC1P78348 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ASIC1P78348 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ASIC1P78348 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ASIC1P78348 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ASIC1P78348 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ASIC1P78348 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ASIC1P78348 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ASIC1P78348 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ASIC1P78348 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ASIC1P78348 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ASIC1P78348 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ASIC1P78348 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ASIC1P78348 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ASIC1P78348 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ASIC1P78348 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ASIC1P78348 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ASIC1P78348 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ASIC1P78348 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ASIC1P78348 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ASIC1P78348 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ASIC1P78348 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ASIC1P78348 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ASIC1P78348 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ASIC1P78348 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ASIC1P78348 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ASIC1P78348 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ASIC1P78348 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ASIC1P78348 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ASIC1P78348 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ASIC1P78348 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ASIC1P78348 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ASIC1P78348 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ASIC1P78348 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ASIC1P78348 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ASIC1P78348 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ASIC1P78348 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ASIC1P78348 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ASIC1P78348 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ASIC1P78348 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ASIC1P78348 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ASIC1P78348 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ASIC1P78348 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ASIC1P78348 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ASIC1P78348 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ASIC1P78348 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ASIC1P78348 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ASIC1P78348 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ASIC1P78348 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ASIC1P78348 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ASIC1P78348 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ASIC1P78348 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ASIC1P78348 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ASIC1P78348 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ASIC1P78348 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ASIC1P78348 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ASIC1P78348 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ASIC1P78348 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ASIC1P78348 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ASIC1P78348 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ASIC1P78348 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ASIC1P78348 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ASIC1P78348 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ASIC1P78348 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ASIC1P78348 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ASIC1P78348 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ASIC1P78348 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ASIC1P78348 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ASIC1P78348 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ASIC1P78348 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ASIC1P78348 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ASIC1P78348 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ASIC1P78348 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ASIC1P78348 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ASIC1P78348 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ASIC1P78348 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ASIC1P78348 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ASIC1P78348 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ASIC1P78348 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms