Protein–RNA interactions for Protein: P62306

SNRPF, Small nuclear ribonucleoprotein F, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPFP62306 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNRPFP62306 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNRPFP62306 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNRPFP62306 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNRPFP62306 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNRPFP62306 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNRPFP62306 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNRPFP62306 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNRPFP62306 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNRPFP62306 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNRPFP62306 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNRPFP62306 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNRPFP62306 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNRPFP62306 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNRPFP62306 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNRPFP62306 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNRPFP62306 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNRPFP62306 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNRPFP62306 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNRPFP62306 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNRPFP62306 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNRPFP62306 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNRPFP62306 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNRPFP62306 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNRPFP62306 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNRPFP62306 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNRPFP62306 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNRPFP62306 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNRPFP62306 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNRPFP62306 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNRPFP62306 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNRPFP62306 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNRPFP62306 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNRPFP62306 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNRPFP62306 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNRPFP62306 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNRPFP62306 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNRPFP62306 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNRPFP62306 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNRPFP62306 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNRPFP62306 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNRPFP62306 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNRPFP62306 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNRPFP62306 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNRPFP62306 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNRPFP62306 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNRPFP62306 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SNRPFP62306 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNRPFP62306 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNRPFP62306 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNRPFP62306 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNRPFP62306 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNRPFP62306 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNRPFP62306 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SNRPFP62306 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNRPFP62306 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNRPFP62306 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNRPFP62306 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNRPFP62306 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNRPFP62306 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNRPFP62306 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNRPFP62306 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SNRPFP62306 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNRPFP62306 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNRPFP62306 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNRPFP62306 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNRPFP62306 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNRPFP62306 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNRPFP62306 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNRPFP62306 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNRPFP62306 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNRPFP62306 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNRPFP62306 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNRPFP62306 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SNRPFP62306 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNRPFP62306 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNRPFP62306 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNRPFP62306 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNRPFP62306 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNRPFP62306 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNRPFP62306 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNRPFP62306 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNRPFP62306 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNRPFP62306 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNRPFP62306 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNRPFP62306 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNRPFP62306 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNRPFP62306 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNRPFP62306 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNRPFP62306 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNRPFP62306 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNRPFP62306 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNRPFP62306 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SNRPFP62306 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNRPFP62306 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNRPFP62306 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNRPFP62306 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNRPFP62306 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNRPFP62306 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNRPFP62306 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms