Protein–RNA interactions for Protein: P55286

CDH8, Cadherin-8, humanhuman

Predictions only

Length 799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH8P55286 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH8P55286 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH8P55286 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH8P55286 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH8P55286 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH8P55286 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH8P55286 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH8P55286 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH8P55286 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH8P55286 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH8P55286 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH8P55286 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH8P55286 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH8P55286 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH8P55286 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH8P55286 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH8P55286 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH8P55286 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH8P55286 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDH8P55286 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDH8P55286 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDH8P55286 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDH8P55286 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDH8P55286 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDH8P55286 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDH8P55286 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDH8P55286 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDH8P55286 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDH8P55286 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDH8P55286 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDH8P55286 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDH8P55286 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDH8P55286 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDH8P55286 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDH8P55286 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDH8P55286 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDH8P55286 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDH8P55286 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDH8P55286 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDH8P55286 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDH8P55286 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDH8P55286 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDH8P55286 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDH8P55286 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDH8P55286 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDH8P55286 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDH8P55286 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
CDH8P55286 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDH8P55286 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDH8P55286 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDH8P55286 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDH8P55286 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDH8P55286 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDH8P55286 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDH8P55286 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDH8P55286 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH8P55286 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH8P55286 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH8P55286 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH8P55286 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH8P55286 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH8P55286 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH8P55286 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH8P55286 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH8P55286 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH8P55286 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH8P55286 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH8P55286 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH8P55286 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH8P55286 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH8P55286 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH8P55286 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH8P55286 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH8P55286 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH8P55286 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH8P55286 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH8P55286 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH8P55286 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH8P55286 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH8P55286 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH8P55286 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH8P55286 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH8P55286 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH8P55286 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH8P55286 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH8P55286 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH8P55286 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH8P55286 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH8P55286 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH8P55286 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH8P55286 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH8P55286 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH8P55286 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH8P55286 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH8P55286 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH8P55286 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH8P55286 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH8P55286 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH8P55286 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH8P55286 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms