Protein–RNA interactions for Protein: P52747

ZNF143, Zinc finger protein 143, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF143P52747 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF143P52747 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF143P52747 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF143P52747 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF143P52747 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF143P52747 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF143P52747 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF143P52747 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF143P52747 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF143P52747 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF143P52747 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF143P52747 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF143P52747 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF143P52747 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF143P52747 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF143P52747 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF143P52747 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF143P52747 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF143P52747 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF143P52747 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF143P52747 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF143P52747 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF143P52747 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF143P52747 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF143P52747 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF143P52747 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF143P52747 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF143P52747 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF143P52747 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZNF143P52747 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZNF143P52747 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZNF143P52747 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZNF143P52747 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF143P52747 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF143P52747 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF143P52747 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF143P52747 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF143P52747 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF143P52747 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF143P52747 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF143P52747 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF143P52747 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF143P52747 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF143P52747 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF143P52747 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF143P52747 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF143P52747 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF143P52747 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF143P52747 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF143P52747 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF143P52747 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF143P52747 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF143P52747 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF143P52747 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF143P52747 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF143P52747 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF143P52747 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF143P52747 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF143P52747 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF143P52747 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF143P52747 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF143P52747 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF143P52747 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF143P52747 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF143P52747 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF143P52747 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF143P52747 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF143P52747 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF143P52747 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF143P52747 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF143P52747 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF143P52747 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF143P52747 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF143P52747 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF143P52747 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF143P52747 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF143P52747 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF143P52747 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF143P52747 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF143P52747 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF143P52747 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF143P52747 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF143P52747 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF143P52747 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF143P52747 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF143P52747 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF143P52747 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF143P52747 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF143P52747 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF143P52747 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF143P52747 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF143P52747 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF143P52747 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF143P52747 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF143P52747 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF143P52747 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF143P52747 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF143P52747 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF143P52747 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF143P52747 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms