Protein–RNA interactions for Protein: P51965

UBE2E1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E1P51965 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBE2E1P51965 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBE2E1P51965 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBE2E1P51965 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBE2E1P51965 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBE2E1P51965 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBE2E1P51965 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBE2E1P51965 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBE2E1P51965 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
UBE2E1P51965 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
UBE2E1P51965 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBE2E1P51965 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
UBE2E1P51965 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBE2E1P51965 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBE2E1P51965 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
UBE2E1P51965 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
UBE2E1P51965 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
UBE2E1P51965 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
UBE2E1P51965 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
UBE2E1P51965 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
UBE2E1P51965 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBE2E1P51965 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBE2E1P51965 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBE2E1P51965 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBE2E1P51965 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBE2E1P51965 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBE2E1P51965 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBE2E1P51965 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBE2E1P51965 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBE2E1P51965 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBE2E1P51965 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBE2E1P51965 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBE2E1P51965 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBE2E1P51965 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBE2E1P51965 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBE2E1P51965 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBE2E1P51965 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBE2E1P51965 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBE2E1P51965 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBE2E1P51965 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBE2E1P51965 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBE2E1P51965 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBE2E1P51965 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
UBE2E1P51965 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBE2E1P51965 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBE2E1P51965 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBE2E1P51965 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBE2E1P51965 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBE2E1P51965 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBE2E1P51965 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBE2E1P51965 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBE2E1P51965 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBE2E1P51965 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBE2E1P51965 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBE2E1P51965 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBE2E1P51965 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBE2E1P51965 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBE2E1P51965 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBE2E1P51965 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBE2E1P51965 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBE2E1P51965 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2E1P51965 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2E1P51965 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2E1P51965 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2E1P51965 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2E1P51965 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2E1P51965 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2E1P51965 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2E1P51965 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2E1P51965 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2E1P51965 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2E1P51965 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2E1P51965 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2E1P51965 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2E1P51965 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2E1P51965 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2E1P51965 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2E1P51965 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2E1P51965 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2E1P51965 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2E1P51965 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2E1P51965 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2E1P51965 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2E1P51965 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2E1P51965 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2E1P51965 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2E1P51965 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UBE2E1P51965 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBE2E1P51965 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBE2E1P51965 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBE2E1P51965 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBE2E1P51965 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBE2E1P51965 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBE2E1P51965 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBE2E1P51965 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBE2E1P51965 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBE2E1P51965 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBE2E1P51965 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBE2E1P51965 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UBE2E1P51965 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms