Protein–RNA interactions for Protein: P50458

LHX2, LIM/homeobox protein Lhx2, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX2P50458 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LHX2P50458 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LHX2P50458 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LHX2P50458 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LHX2P50458 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LHX2P50458 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LHX2P50458 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LHX2P50458 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LHX2P50458 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LHX2P50458 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LHX2P50458 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LHX2P50458 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LHX2P50458 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LHX2P50458 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LHX2P50458 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LHX2P50458 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LHX2P50458 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LHX2P50458 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LHX2P50458 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LHX2P50458 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LHX2P50458 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LHX2P50458 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
LHX2P50458 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LHX2P50458 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LHX2P50458 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LHX2P50458 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LHX2P50458 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LHX2P50458 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
LHX2P50458 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LHX2P50458 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LHX2P50458 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LHX2P50458 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LHX2P50458 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LHX2P50458 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LHX2P50458 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LHX2P50458 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LHX2P50458 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LHX2P50458 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LHX2P50458 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LHX2P50458 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LHX2P50458 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LHX2P50458 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LHX2P50458 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LHX2P50458 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LHX2P50458 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LHX2P50458 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LHX2P50458 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LHX2P50458 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LHX2P50458 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LHX2P50458 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LHX2P50458 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LHX2P50458 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LHX2P50458 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LHX2P50458 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LHX2P50458 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LHX2P50458 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LHX2P50458 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LHX2P50458 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LHX2P50458 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LHX2P50458 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
LHX2P50458 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LHX2P50458 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LHX2P50458 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LHX2P50458 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LHX2P50458 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LHX2P50458 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LHX2P50458 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LHX2P50458 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LHX2P50458 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LHX2P50458 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LHX2P50458 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LHX2P50458 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
LHX2P50458 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LHX2P50458 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LHX2P50458 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LHX2P50458 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
LHX2P50458 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LHX2P50458 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LHX2P50458 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LHX2P50458 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LHX2P50458 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LHX2P50458 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LHX2P50458 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LHX2P50458 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LHX2P50458 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LHX2P50458 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LHX2P50458 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LHX2P50458 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LHX2P50458 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LHX2P50458 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LHX2P50458 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
LHX2P50458 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LHX2P50458 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
LHX2P50458 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LHX2P50458 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LHX2P50458 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LHX2P50458 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LHX2P50458 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LHX2P50458 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LHX2P50458 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms