Protein–RNA interactions for Protein: P50213

IDH3A, Isocitrate dehydrogenase [NAD] subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IDH3AP50213 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IDH3AP50213 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IDH3AP50213 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IDH3AP50213 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IDH3AP50213 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IDH3AP50213 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IDH3AP50213 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IDH3AP50213 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IDH3AP50213 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
IDH3AP50213 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IDH3AP50213 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IDH3AP50213 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IDH3AP50213 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
IDH3AP50213 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
IDH3AP50213 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IDH3AP50213 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IDH3AP50213 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IDH3AP50213 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
IDH3AP50213 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IDH3AP50213 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IDH3AP50213 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IDH3AP50213 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
IDH3AP50213 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IDH3AP50213 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IDH3AP50213 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
IDH3AP50213 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
IDH3AP50213 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IDH3AP50213 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
IDH3AP50213 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
IDH3AP50213 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
IDH3AP50213 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
IDH3AP50213 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
IDH3AP50213 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IDH3AP50213 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IDH3AP50213 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
IDH3AP50213 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
IDH3AP50213 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IDH3AP50213 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
IDH3AP50213 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
IDH3AP50213 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
IDH3AP50213 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IDH3AP50213 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
IDH3AP50213 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IDH3AP50213 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IDH3AP50213 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
IDH3AP50213 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
IDH3AP50213 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
IDH3AP50213 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
IDH3AP50213 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IDH3AP50213 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IDH3AP50213 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
IDH3AP50213 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IDH3AP50213 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
IDH3AP50213 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
IDH3AP50213 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
IDH3AP50213 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IDH3AP50213 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
IDH3AP50213 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
IDH3AP50213 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IDH3AP50213 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
IDH3AP50213 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IDH3AP50213 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IDH3AP50213 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IDH3AP50213 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
IDH3AP50213 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
IDH3AP50213 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
IDH3AP50213 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
IDH3AP50213 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
IDH3AP50213 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
IDH3AP50213 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
IDH3AP50213 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IDH3AP50213 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IDH3AP50213 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IDH3AP50213 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IDH3AP50213 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IDH3AP50213 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
IDH3AP50213 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IDH3AP50213 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IDH3AP50213 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IDH3AP50213 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IDH3AP50213 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
IDH3AP50213 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
IDH3AP50213 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IDH3AP50213 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IDH3AP50213 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
IDH3AP50213 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IDH3AP50213 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IDH3AP50213 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
IDH3AP50213 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IDH3AP50213 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
IDH3AP50213 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
IDH3AP50213 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
IDH3AP50213 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
IDH3AP50213 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
IDH3AP50213 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
IDH3AP50213 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
IDH3AP50213 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
IDH3AP50213 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
IDH3AP50213 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
IDH3AP50213 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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