Protein–RNA interactions for Protein: P48728

AMT, Aminomethyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMTP48728 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AMTP48728 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AMTP48728 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AMTP48728 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AMTP48728 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
AMTP48728 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AMTP48728 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AMTP48728 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AMTP48728 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
AMTP48728 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AMTP48728 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AMTP48728 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AMTP48728 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AMTP48728 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AMTP48728 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AMTP48728 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AMTP48728 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AMTP48728 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AMTP48728 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AMTP48728 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AMTP48728 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AMTP48728 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
AMTP48728 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
AMTP48728 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AMTP48728 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AMTP48728 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AMTP48728 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AMTP48728 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AMTP48728 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMTP48728 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMTP48728 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMTP48728 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMTP48728 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMTP48728 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMTP48728 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMTP48728 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMTP48728 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMTP48728 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMTP48728 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMTP48728 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMTP48728 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMTP48728 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMTP48728 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMTP48728 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMTP48728 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMTP48728 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMTP48728 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMTP48728 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMTP48728 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMTP48728 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMTP48728 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AMTP48728 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMTP48728 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMTP48728 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMTP48728 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMTP48728 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMTP48728 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMTP48728 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMTP48728 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMTP48728 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMTP48728 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMTP48728 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
AMTP48728 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMTP48728 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMTP48728 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMTP48728 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMTP48728 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMTP48728 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AMTP48728 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
AMTP48728 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AMTP48728 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AMTP48728 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AMTP48728 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AMTP48728 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AMTP48728 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AMTP48728 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AMTP48728 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AMTP48728 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AMTP48728 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AMTP48728 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AMTP48728 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AMTP48728 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AMTP48728 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AMTP48728 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AMTP48728 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
AMTP48728 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AMTP48728 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
AMTP48728 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AMTP48728 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AMTP48728 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AMTP48728 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AMTP48728 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AMTP48728 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AMTP48728 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AMTP48728 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AMTP48728 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AMTP48728 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AMTP48728 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AMTP48728 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AMTP48728 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms