Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ME1P48163 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ME1P48163 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
ME1P48163 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ME1P48163 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ME1P48163 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ME1P48163 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ME1P48163 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ME1P48163 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ME1P48163 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ME1P48163 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ME1P48163 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ME1P48163 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ME1P48163 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ME1P48163 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ME1P48163 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ME1P48163 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ME1P48163 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ME1P48163 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ME1P48163 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ME1P48163 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ME1P48163 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ME1P48163 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ME1P48163 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ME1P48163 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ME1P48163 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ME1P48163 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ME1P48163 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ME1P48163 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ME1P48163 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ME1P48163 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ME1P48163 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ME1P48163 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ME1P48163 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ME1P48163 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ME1P48163 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ME1P48163 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ME1P48163 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ME1P48163 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ME1P48163 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ME1P48163 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ME1P48163 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ME1P48163 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ME1P48163 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ME1P48163 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ME1P48163 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ME1P48163 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ME1P48163 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ME1P48163 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ME1P48163 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ME1P48163 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ME1P48163 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ME1P48163 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ME1P48163 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ME1P48163 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ME1P48163 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ME1P48163 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ME1P48163 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ME1P48163 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ME1P48163 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ME1P48163 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ME1P48163 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ME1P48163 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ME1P48163 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ME1P48163 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ME1P48163 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ME1P48163 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ME1P48163 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ME1P48163 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ME1P48163 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ME1P48163 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ME1P48163 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ME1P48163 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ME1P48163 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ME1P48163 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ME1P48163 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ME1P48163 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ME1P48163 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ME1P48163 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ME1P48163 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ME1P48163 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ME1P48163 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ME1P48163 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ME1P48163 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ME1P48163 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ME1P48163 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ME1P48163 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ME1P48163 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ME1P48163 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ME1P48163 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ME1P48163 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ME1P48163 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ME1P48163 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ME1P48163 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ME1P48163 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ME1P48163 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ME1P48163 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ME1P48163 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ME1P48163 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ME1P48163 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms