Protein–RNA interactions for Protein: P45379

TNNT2, Troponin T, cardiac muscle, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT2P45379 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TNNT2P45379 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TNNT2P45379 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TNNT2P45379 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
TNNT2P45379 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TNNT2P45379 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TNNT2P45379 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TNNT2P45379 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TNNT2P45379 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TNNT2P45379 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TNNT2P45379 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TNNT2P45379 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TNNT2P45379 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TNNT2P45379 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
TNNT2P45379 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TNNT2P45379 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TNNT2P45379 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TNNT2P45379 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TNNT2P45379 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TNNT2P45379 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TNNT2P45379 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TNNT2P45379 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TNNT2P45379 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TNNT2P45379 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TNNT2P45379 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TNNT2P45379 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
TNNT2P45379 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
TNNT2P45379 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TNNT2P45379 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TNNT2P45379 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TNNT2P45379 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TNNT2P45379 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
TNNT2P45379 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TNNT2P45379 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TNNT2P45379 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
TNNT2P45379 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TNNT2P45379 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TNNT2P45379 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TNNT2P45379 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TNNT2P45379 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TNNT2P45379 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TNNT2P45379 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TNNT2P45379 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
TNNT2P45379 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TNNT2P45379 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
TNNT2P45379 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TNNT2P45379 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TNNT2P45379 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
TNNT2P45379 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TNNT2P45379 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TNNT2P45379 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TNNT2P45379 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TNNT2P45379 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TNNT2P45379 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TNNT2P45379 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TNNT2P45379 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TNNT2P45379 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC28.01■■■□□ 2.08
TNNT2P45379 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TNNT2P45379 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TNNT2P45379 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
TNNT2P45379 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TNNT2P45379 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TNNT2P45379 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TNNT2P45379 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
TNNT2P45379 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TNNT2P45379 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TNNT2P45379 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TNNT2P45379 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TNNT2P45379 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
TNNT2P45379 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
TNNT2P45379 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TNNT2P45379 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC28■■■□□ 2.07
TNNT2P45379 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TNNT2P45379 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TNNT2P45379 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TNNT2P45379 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TNNT2P45379 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TNNT2P45379 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TNNT2P45379 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TNNT2P45379 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TNNT2P45379 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TNNT2P45379 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TNNT2P45379 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TNNT2P45379 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
TNNT2P45379 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TNNT2P45379 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TNNT2P45379 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TNNT2P45379 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TNNT2P45379 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TNNT2P45379 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TNNT2P45379 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TNNT2P45379 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TNNT2P45379 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TNNT2P45379 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TNNT2P45379 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TNNT2P45379 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TNNT2P45379 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
TNNT2P45379 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TNNT2P45379 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TNNT2P45379 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms