Protein–RNA interactions for Protein: P39086

GRIK1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK1P39086 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GRIK1P39086 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GRIK1P39086 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
GRIK1P39086 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GRIK1P39086 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GRIK1P39086 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GRIK1P39086 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GRIK1P39086 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GRIK1P39086 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GRIK1P39086 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GRIK1P39086 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GRIK1P39086 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GRIK1P39086 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GRIK1P39086 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
GRIK1P39086 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GRIK1P39086 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GRIK1P39086 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRIK1P39086 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRIK1P39086 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRIK1P39086 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRIK1P39086 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRIK1P39086 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRIK1P39086 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRIK1P39086 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
GRIK1P39086 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRIK1P39086 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
GRIK1P39086 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRIK1P39086 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRIK1P39086 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRIK1P39086 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRIK1P39086 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRIK1P39086 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRIK1P39086 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRIK1P39086 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRIK1P39086 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRIK1P39086 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRIK1P39086 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRIK1P39086 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRIK1P39086 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GRIK1P39086 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GRIK1P39086 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GRIK1P39086 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GRIK1P39086 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GRIK1P39086 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GRIK1P39086 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GRIK1P39086 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
GRIK1P39086 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GRIK1P39086 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GRIK1P39086 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GRIK1P39086 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GRIK1P39086 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GRIK1P39086 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GRIK1P39086 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GRIK1P39086 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GRIK1P39086 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GRIK1P39086 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GRIK1P39086 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GRIK1P39086 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GRIK1P39086 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GRIK1P39086 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GRIK1P39086 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GRIK1P39086 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GRIK1P39086 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GRIK1P39086 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GRIK1P39086 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GRIK1P39086 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
GRIK1P39086 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GRIK1P39086 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GRIK1P39086 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GRIK1P39086 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GRIK1P39086 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GRIK1P39086 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GRIK1P39086 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIK1P39086 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIK1P39086 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIK1P39086 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIK1P39086 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIK1P39086 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIK1P39086 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIK1P39086 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIK1P39086 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIK1P39086 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIK1P39086 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIK1P39086 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIK1P39086 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIK1P39086 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIK1P39086 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIK1P39086 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIK1P39086 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIK1P39086 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIK1P39086 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIK1P39086 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIK1P39086 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIK1P39086 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIK1P39086 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIK1P39086 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIK1P39086 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIK1P39086 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GRIK1P39086 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GRIK1P39086 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms