Protein–RNA interactions for Protein: P38919

EIF4A3, Eukaryotic initiation factor 4A-III, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4A3P38919 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EIF4A3P38919 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EIF4A3P38919 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EIF4A3P38919 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EIF4A3P38919 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EIF4A3P38919 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EIF4A3P38919 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EIF4A3P38919 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EIF4A3P38919 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EIF4A3P38919 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EIF4A3P38919 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EIF4A3P38919 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EIF4A3P38919 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EIF4A3P38919 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EIF4A3P38919 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EIF4A3P38919 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF4A3P38919 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF4A3P38919 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF4A3P38919 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF4A3P38919 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF4A3P38919 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF4A3P38919 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF4A3P38919 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF4A3P38919 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF4A3P38919 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF4A3P38919 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF4A3P38919 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF4A3P38919 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF4A3P38919 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF4A3P38919 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF4A3P38919 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF4A3P38919 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF4A3P38919 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF4A3P38919 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF4A3P38919 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF4A3P38919 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF4A3P38919 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF4A3P38919 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF4A3P38919 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF4A3P38919 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF4A3P38919 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF4A3P38919 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF4A3P38919 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF4A3P38919 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF4A3P38919 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF4A3P38919 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF4A3P38919 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF4A3P38919 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF4A3P38919 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF4A3P38919 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF4A3P38919 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF4A3P38919 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF4A3P38919 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF4A3P38919 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF4A3P38919 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF4A3P38919 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF4A3P38919 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF4A3P38919 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EIF4A3P38919 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EIF4A3P38919 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EIF4A3P38919 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EIF4A3P38919 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EIF4A3P38919 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
EIF4A3P38919 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EIF4A3P38919 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EIF4A3P38919 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EIF4A3P38919 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EIF4A3P38919 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EIF4A3P38919 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EIF4A3P38919 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EIF4A3P38919 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EIF4A3P38919 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
EIF4A3P38919 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EIF4A3P38919 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EIF4A3P38919 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EIF4A3P38919 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EIF4A3P38919 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EIF4A3P38919 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EIF4A3P38919 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EIF4A3P38919 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EIF4A3P38919 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EIF4A3P38919 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EIF4A3P38919 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EIF4A3P38919 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EIF4A3P38919 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EIF4A3P38919 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EIF4A3P38919 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
EIF4A3P38919 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EIF4A3P38919 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EIF4A3P38919 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EIF4A3P38919 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EIF4A3P38919 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
EIF4A3P38919 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EIF4A3P38919 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EIF4A3P38919 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EIF4A3P38919 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EIF4A3P38919 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EIF4A3P38919 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EIF4A3P38919 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EIF4A3P38919 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms