Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTNNB1P35222 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTNNB1P35222 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTNNB1P35222 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTNNB1P35222 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CTNNB1P35222 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTNNB1P35222 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTNNB1P35222 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTNNB1P35222 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTNNB1P35222 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTNNB1P35222 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTNNB1P35222 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTNNB1P35222 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CTNNB1P35222 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTNNB1P35222 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CTNNB1P35222 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CTNNB1P35222 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTNNB1P35222 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CTNNB1P35222 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CTNNB1P35222 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CTNNB1P35222 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTNNB1P35222 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTNNB1P35222 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTNNB1P35222 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTNNB1P35222 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTNNB1P35222 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CTNNB1P35222 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTNNB1P35222 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTNNB1P35222 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTNNB1P35222 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTNNB1P35222 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTNNB1P35222 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTNNB1P35222 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTNNB1P35222 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTNNB1P35222 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTNNB1P35222 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTNNB1P35222 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTNNB1P35222 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTNNB1P35222 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTNNB1P35222 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTNNB1P35222 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTNNB1P35222 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTNNB1P35222 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTNNB1P35222 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTNNB1P35222 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTNNB1P35222 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTNNB1P35222 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTNNB1P35222 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTNNB1P35222 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTNNB1P35222 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTNNB1P35222 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTNNB1P35222 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTNNB1P35222 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTNNB1P35222 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTNNB1P35222 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTNNB1P35222 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTNNB1P35222 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTNNB1P35222 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTNNB1P35222 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CTNNB1P35222 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTNNB1P35222 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTNNB1P35222 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTNNB1P35222 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTNNB1P35222 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTNNB1P35222 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTNNB1P35222 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTNNB1P35222 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTNNB1P35222 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CTNNB1P35222 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTNNB1P35222 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CTNNB1P35222 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTNNB1P35222 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTNNB1P35222 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTNNB1P35222 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTNNB1P35222 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTNNB1P35222 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTNNB1P35222 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CTNNB1P35222 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTNNB1P35222 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTNNB1P35222 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTNNB1P35222 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTNNB1P35222 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTNNB1P35222 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTNNB1P35222 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CTNNB1P35222 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTNNB1P35222 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTNNB1P35222 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTNNB1P35222 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTNNB1P35222 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTNNB1P35222 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTNNB1P35222 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTNNB1P35222 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTNNB1P35222 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTNNB1P35222 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTNNB1P35222 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTNNB1P35222 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTNNB1P35222 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTNNB1P35222 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTNNB1P35222 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTNNB1P35222 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms