Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXA13P31271 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXA13P31271 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXA13P31271 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXA13P31271 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXA13P31271 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXA13P31271 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXA13P31271 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXA13P31271 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXA13P31271 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXA13P31271 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXA13P31271 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXA13P31271 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXA13P31271 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXA13P31271 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXA13P31271 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXA13P31271 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXA13P31271 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXA13P31271 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXA13P31271 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXA13P31271 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXA13P31271 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXA13P31271 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXA13P31271 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXA13P31271 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXA13P31271 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXA13P31271 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXA13P31271 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXA13P31271 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXA13P31271 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXA13P31271 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXA13P31271 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXA13P31271 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXA13P31271 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXA13P31271 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXA13P31271 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXA13P31271 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXA13P31271 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXA13P31271 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXA13P31271 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXA13P31271 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXA13P31271 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXA13P31271 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXA13P31271 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXA13P31271 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXA13P31271 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXA13P31271 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXA13P31271 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXA13P31271 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXA13P31271 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXA13P31271 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXA13P31271 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXA13P31271 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXA13P31271 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXA13P31271 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXA13P31271 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXA13P31271 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXA13P31271 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXA13P31271 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXA13P31271 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXA13P31271 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXA13P31271 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXA13P31271 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXA13P31271 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXA13P31271 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXA13P31271 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXA13P31271 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXA13P31271 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXA13P31271 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXA13P31271 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXA13P31271 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXA13P31271 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXA13P31271 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXA13P31271 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXA13P31271 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXA13P31271 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXA13P31271 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXA13P31271 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXA13P31271 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXA13P31271 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXA13P31271 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXA13P31271 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXA13P31271 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXA13P31271 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXA13P31271 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXA13P31271 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HOXA13P31271 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXA13P31271 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXA13P31271 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXA13P31271 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXA13P31271 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXA13P31271 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXA13P31271 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXA13P31271 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXA13P31271 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXA13P31271 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXA13P31271 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXA13P31271 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXA13P31271 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXA13P31271 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms