Protein–RNA interactions for Protein: P29120

PCSK1, Neuroendocrine convertase 1, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK1P29120 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCSK1P29120 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PCSK1P29120 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCSK1P29120 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCSK1P29120 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCSK1P29120 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCSK1P29120 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCSK1P29120 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCSK1P29120 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCSK1P29120 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PCSK1P29120 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PCSK1P29120 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PCSK1P29120 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PCSK1P29120 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PCSK1P29120 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PCSK1P29120 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PCSK1P29120 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PCSK1P29120 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PCSK1P29120 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PCSK1P29120 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PCSK1P29120 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PCSK1P29120 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PCSK1P29120 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PCSK1P29120 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PCSK1P29120 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PCSK1P29120 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PCSK1P29120 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PCSK1P29120 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCSK1P29120 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCSK1P29120 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCSK1P29120 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCSK1P29120 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCSK1P29120 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCSK1P29120 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCSK1P29120 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCSK1P29120 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCSK1P29120 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCSK1P29120 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCSK1P29120 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PCSK1P29120 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PCSK1P29120 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PCSK1P29120 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCSK1P29120 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCSK1P29120 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCSK1P29120 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCSK1P29120 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCSK1P29120 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCSK1P29120 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCSK1P29120 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PCSK1P29120 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCSK1P29120 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCSK1P29120 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCSK1P29120 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCSK1P29120 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCSK1P29120 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCSK1P29120 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCSK1P29120 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCSK1P29120 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCSK1P29120 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCSK1P29120 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCSK1P29120 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PCSK1P29120 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCSK1P29120 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCSK1P29120 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCSK1P29120 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCSK1P29120 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCSK1P29120 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCSK1P29120 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCSK1P29120 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCSK1P29120 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCSK1P29120 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCSK1P29120 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCSK1P29120 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCSK1P29120 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCSK1P29120 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCSK1P29120 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCSK1P29120 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCSK1P29120 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCSK1P29120 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCSK1P29120 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCSK1P29120 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCSK1P29120 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCSK1P29120 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCSK1P29120 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PCSK1P29120 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PCSK1P29120 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PCSK1P29120 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PCSK1P29120 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PCSK1P29120 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PCSK1P29120 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PCSK1P29120 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PCSK1P29120 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PCSK1P29120 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PCSK1P29120 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PCSK1P29120 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PCSK1P29120 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PCSK1P29120 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PCSK1P29120 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PCSK1P29120 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PCSK1P29120 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
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