Protein–RNA interactions for Protein: P28702

RXRB, Retinoic acid receptor RXR-beta, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRBP28702 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC27.56■■■□□ 2
RXRBP28702 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
RXRBP28702 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RXRBP28702 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RXRBP28702 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RXRBP28702 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RXRBP28702 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC27.55■■■□□ 2
RXRBP28702 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RXRBP28702 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
RXRBP28702 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC27.55■■■□□ 2
RXRBP28702 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RXRBP28702 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RXRBP28702 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
RXRBP28702 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
RXRBP28702 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC27.54■■■□□ 2
RXRBP28702 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC27.54■■■□□ 2
RXRBP28702 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
RXRBP28702 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RXRBP28702 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC27.53■■■□□ 2
RXRBP28702 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
RXRBP28702 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RXRBP28702 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RXRBP28702 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC27.53■■■□□ 2
RXRBP28702 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RXRBP28702 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RXRBP28702 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RXRBP28702 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RXRBP28702 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RXRBP28702 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RXRBP28702 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RXRBP28702 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
RXRBP28702 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
RXRBP28702 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
RXRBP28702 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RXRBP28702 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
RXRBP28702 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
RXRBP28702 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
RXRBP28702 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
RXRBP28702 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
RXRBP28702 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RXRBP28702 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RXRBP28702 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RXRBP28702 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RXRBP28702 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
RXRBP28702 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RXRBP28702 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RXRBP28702 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RXRBP28702 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RXRBP28702 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RXRBP28702 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RXRBP28702 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RXRBP28702 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
RXRBP28702 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RXRBP28702 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RXRBP28702 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RXRBP28702 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
RXRBP28702 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RXRBP28702 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RXRBP28702 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RXRBP28702 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RXRBP28702 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RXRBP28702 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RXRBP28702 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RXRBP28702 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RXRBP28702 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
RXRBP28702 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
RXRBP28702 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RXRBP28702 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RXRBP28702 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
RXRBP28702 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RXRBP28702 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RXRBP28702 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RXRBP28702 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RXRBP28702 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RXRBP28702 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RXRBP28702 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RXRBP28702 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RXRBP28702 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RXRBP28702 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RXRBP28702 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RXRBP28702 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RXRBP28702 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RXRBP28702 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RXRBP28702 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RXRBP28702 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RXRBP28702 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RXRBP28702 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RXRBP28702 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RXRBP28702 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RXRBP28702 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RXRBP28702 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RXRBP28702 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
RXRBP28702 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RXRBP28702 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RXRBP28702 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RXRBP28702 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RXRBP28702 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RXRBP28702 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RXRBP28702 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
RXRBP28702 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms