Protein–RNA interactions for Protein: P28300

LOX, Protein-lysine 6-oxidase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXP28300 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LOXP28300 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LOXP28300 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LOXP28300 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LOXP28300 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LOXP28300 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LOXP28300 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LOXP28300 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LOXP28300 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LOXP28300 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LOXP28300 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
LOXP28300 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LOXP28300 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LOXP28300 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LOXP28300 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
LOXP28300 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LOXP28300 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LOXP28300 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LOXP28300 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LOXP28300 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
LOXP28300 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LOXP28300 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LOXP28300 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LOXP28300 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LOXP28300 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LOXP28300 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LOXP28300 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LOXP28300 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LOXP28300 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
LOXP28300 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LOXP28300 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LOXP28300 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LOXP28300 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LOXP28300 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LOXP28300 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LOXP28300 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LOXP28300 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LOXP28300 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
LOXP28300 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LOXP28300 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LOXP28300 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LOXP28300 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LOXP28300 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LOXP28300 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LOXP28300 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LOXP28300 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LOXP28300 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LOXP28300 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LOXP28300 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LOXP28300 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LOXP28300 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LOXP28300 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LOXP28300 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LOXP28300 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LOXP28300 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LOXP28300 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LOXP28300 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LOXP28300 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LOXP28300 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LOXP28300 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LOXP28300 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LOXP28300 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LOXP28300 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LOXP28300 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LOXP28300 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LOXP28300 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LOXP28300 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LOXP28300 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LOXP28300 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LOXP28300 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LOXP28300 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
LOXP28300 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LOXP28300 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LOXP28300 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LOXP28300 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LOXP28300 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
LOXP28300 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LOXP28300 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LOXP28300 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LOXP28300 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LOXP28300 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LOXP28300 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LOXP28300 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LOXP28300 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
LOXP28300 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LOXP28300 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LOXP28300 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LOXP28300 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LOXP28300 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LOXP28300 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LOXP28300 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LOXP28300 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LOXP28300 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LOXP28300 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LOXP28300 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LOXP28300 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LOXP28300 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LOXP28300 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LOXP28300 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LOXP28300 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms