Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SSFA2P28290 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SSFA2P28290 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SSFA2P28290 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SSFA2P28290 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SSFA2P28290 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SSFA2P28290 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SSFA2P28290 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SSFA2P28290 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SSFA2P28290 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SSFA2P28290 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SSFA2P28290 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SSFA2P28290 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SSFA2P28290 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SSFA2P28290 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SSFA2P28290 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SSFA2P28290 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
SSFA2P28290 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SSFA2P28290 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SSFA2P28290 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SSFA2P28290 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SSFA2P28290 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SSFA2P28290 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SSFA2P28290 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SSFA2P28290 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SSFA2P28290 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SSFA2P28290 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SSFA2P28290 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SSFA2P28290 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SSFA2P28290 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
SSFA2P28290 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SSFA2P28290 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SSFA2P28290 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SSFA2P28290 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SSFA2P28290 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SSFA2P28290 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SSFA2P28290 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SSFA2P28290 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SSFA2P28290 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SSFA2P28290 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SSFA2P28290 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SSFA2P28290 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SSFA2P28290 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SSFA2P28290 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
SSFA2P28290 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SSFA2P28290 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SSFA2P28290 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SSFA2P28290 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SSFA2P28290 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SSFA2P28290 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SSFA2P28290 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SSFA2P28290 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SSFA2P28290 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SSFA2P28290 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
SSFA2P28290 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SSFA2P28290 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SSFA2P28290 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SSFA2P28290 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SSFA2P28290 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SSFA2P28290 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SSFA2P28290 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SSFA2P28290 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SSFA2P28290 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SSFA2P28290 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SSFA2P28290 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SSFA2P28290 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SSFA2P28290 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SSFA2P28290 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SSFA2P28290 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SSFA2P28290 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SSFA2P28290 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SSFA2P28290 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SSFA2P28290 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SSFA2P28290 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SSFA2P28290 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SSFA2P28290 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SSFA2P28290 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SSFA2P28290 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
SSFA2P28290 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SSFA2P28290 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SSFA2P28290 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SSFA2P28290 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SSFA2P28290 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SSFA2P28290 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SSFA2P28290 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SSFA2P28290 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SSFA2P28290 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SSFA2P28290 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SSFA2P28290 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SSFA2P28290 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SSFA2P28290 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SSFA2P28290 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SSFA2P28290 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SSFA2P28290 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SSFA2P28290 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
SSFA2P28290 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
SSFA2P28290 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SSFA2P28290 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SSFA2P28290 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SSFA2P28290 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms