Protein–RNA interactions for Protein: P26599

PTBP1, Polypyrimidine tract-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 531 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTBP1P26599 PROX1-AS1-222ENST00000625209 389 ntTSL 511.67□□□□□ -0.546e-17■■■■■ 35.6
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PTBP1P26599 PKP4-207ENST00000457109 520 ntTSL 36.64□□□□□ -1.359e-7■■■■■ 35.5
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PTBP1P26599 KIAA1958-201ENST00000337530 11775 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.095e-7■■■■■ 35.5
PTBP1P26599 KIAA1958-203ENST00000536272 7650 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.385e-7■■■■■ 35.5
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PTBP1P26599 AGAP1-206ENST00000418654 826 ntTSL 36.43□□□□□ -1.382e-10■■■■■ 35.5
PTBP1P26599 MMS22L-201ENST00000275053 8643 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.191e-7■■■■■ 35.5
PTBP1P26599 TLN1-202ENST00000378192 1693 ntTSL 210.45□□□□□ -0.742e-8■■■■■ 35.5
PTBP1P26599 APOLD1-203ENST00000534843 2375 ntTSL 214.67□□□□□ -0.061e-7■■■■■ 35.5
PTBP1P26599 DDX47-202ENST00000358007 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.881e-7■■■■■ 35.5
PTBP1P26599 DDX47-209ENST00000544032 1044 ntTSL 29.44□□□□□ -0.91e-7■■■■■ 35.5
PTBP1P26599 DDX47-206ENST00000541537 1517 ntTSL 1 (best)8.49□□□□□ -1.051e-7■■■■■ 35.5
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