Protein–RNA interactions for Protein: P23511

NFYA, Nuclear transcription factor Y subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFYAP23511 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NFYAP23511 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NFYAP23511 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NFYAP23511 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NFYAP23511 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NFYAP23511 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NFYAP23511 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NFYAP23511 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NFYAP23511 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NFYAP23511 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
NFYAP23511 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NFYAP23511 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NFYAP23511 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NFYAP23511 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NFYAP23511 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NFYAP23511 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NFYAP23511 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NFYAP23511 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NFYAP23511 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NFYAP23511 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NFYAP23511 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NFYAP23511 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NFYAP23511 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NFYAP23511 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NFYAP23511 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NFYAP23511 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NFYAP23511 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NFYAP23511 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NFYAP23511 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NFYAP23511 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NFYAP23511 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
NFYAP23511 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NFYAP23511 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NFYAP23511 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NFYAP23511 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NFYAP23511 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NFYAP23511 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NFYAP23511 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NFYAP23511 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NFYAP23511 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NFYAP23511 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NFYAP23511 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NFYAP23511 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NFYAP23511 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NFYAP23511 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NFYAP23511 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NFYAP23511 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NFYAP23511 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NFYAP23511 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NFYAP23511 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NFYAP23511 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
NFYAP23511 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NFYAP23511 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NFYAP23511 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NFYAP23511 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NFYAP23511 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NFYAP23511 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NFYAP23511 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NFYAP23511 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NFYAP23511 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NFYAP23511 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NFYAP23511 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NFYAP23511 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NFYAP23511 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NFYAP23511 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NFYAP23511 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NFYAP23511 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NFYAP23511 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NFYAP23511 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
NFYAP23511 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NFYAP23511 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NFYAP23511 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NFYAP23511 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NFYAP23511 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NFYAP23511 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NFYAP23511 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NFYAP23511 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NFYAP23511 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NFYAP23511 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NFYAP23511 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NFYAP23511 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NFYAP23511 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NFYAP23511 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NFYAP23511 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NFYAP23511 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NFYAP23511 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NFYAP23511 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NFYAP23511 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NFYAP23511 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NFYAP23511 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NFYAP23511 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NFYAP23511 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NFYAP23511 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NFYAP23511 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NFYAP23511 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NFYAP23511 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NFYAP23511 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NFYAP23511 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NFYAP23511 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NFYAP23511 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms