Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRDP23468 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRDP23468 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRDP23468 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRDP23468 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRDP23468 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRDP23468 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRDP23468 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRDP23468 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRDP23468 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRDP23468 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRDP23468 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRDP23468 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRDP23468 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRDP23468 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRDP23468 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRDP23468 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRDP23468 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRDP23468 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRDP23468 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRDP23468 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRDP23468 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRDP23468 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRDP23468 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRDP23468 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRDP23468 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRDP23468 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRDP23468 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTPRDP23468 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRDP23468 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRDP23468 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRDP23468 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRDP23468 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRDP23468 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRDP23468 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRDP23468 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPRDP23468 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PTPRDP23468 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
PTPRDP23468 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.07
PTPRDP23468 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PTPRDP23468 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
PTPRDP23468 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
PTPRDP23468 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PTPRDP23468 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRDP23468 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRDP23468 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRDP23468 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRDP23468 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRDP23468 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRDP23468 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRDP23468 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRDP23468 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRDP23468 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRDP23468 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRDP23468 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRDP23468 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRDP23468 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRDP23468 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRDP23468 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRDP23468 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRDP23468 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRDP23468 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRDP23468 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRDP23468 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRDP23468 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRDP23468 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRDP23468 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRDP23468 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRDP23468 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRDP23468 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRDP23468 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRDP23468 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRDP23468 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRDP23468 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRDP23468 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRDP23468 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRDP23468 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRDP23468 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRDP23468 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRDP23468 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRDP23468 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRDP23468 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRDP23468 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRDP23468 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRDP23468 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRDP23468 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRDP23468 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRDP23468 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRDP23468 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRDP23468 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRDP23468 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRDP23468 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRDP23468 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRDP23468 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRDP23468 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRDP23468 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRDP23468 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRDP23468 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRDP23468 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRDP23468 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
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