Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LMNB1P20700 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LMNB1P20700 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LMNB1P20700 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LMNB1P20700 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LMNB1P20700 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LMNB1P20700 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LMNB1P20700 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
LMNB1P20700 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LMNB1P20700 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LMNB1P20700 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LMNB1P20700 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LMNB1P20700 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LMNB1P20700 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LMNB1P20700 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LMNB1P20700 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LMNB1P20700 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LMNB1P20700 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LMNB1P20700 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LMNB1P20700 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LMNB1P20700 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LMNB1P20700 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LMNB1P20700 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LMNB1P20700 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LMNB1P20700 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LMNB1P20700 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LMNB1P20700 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LMNB1P20700 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LMNB1P20700 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LMNB1P20700 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LMNB1P20700 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LMNB1P20700 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LMNB1P20700 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMNB1P20700 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMNB1P20700 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMNB1P20700 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMNB1P20700 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
LMNB1P20700 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMNB1P20700 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMNB1P20700 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMNB1P20700 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMNB1P20700 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMNB1P20700 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMNB1P20700 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMNB1P20700 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMNB1P20700 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMNB1P20700 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMNB1P20700 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMNB1P20700 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMNB1P20700 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMNB1P20700 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMNB1P20700 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMNB1P20700 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMNB1P20700 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMNB1P20700 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMNB1P20700 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMNB1P20700 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMNB1P20700 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMNB1P20700 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMNB1P20700 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMNB1P20700 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LMNB1P20700 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LMNB1P20700 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LMNB1P20700 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LMNB1P20700 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LMNB1P20700 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LMNB1P20700 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LMNB1P20700 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LMNB1P20700 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LMNB1P20700 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LMNB1P20700 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LMNB1P20700 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LMNB1P20700 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LMNB1P20700 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LMNB1P20700 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LMNB1P20700 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LMNB1P20700 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LMNB1P20700 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LMNB1P20700 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LMNB1P20700 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LMNB1P20700 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LMNB1P20700 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LMNB1P20700 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LMNB1P20700 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LMNB1P20700 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LMNB1P20700 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LMNB1P20700 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LMNB1P20700 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LMNB1P20700 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LMNB1P20700 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LMNB1P20700 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LMNB1P20700 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LMNB1P20700 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LMNB1P20700 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LMNB1P20700 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LMNB1P20700 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LMNB1P20700 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LMNB1P20700 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LMNB1P20700 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
LMNB1P20700 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms