Protein–RNA interactions for Protein: P20337

RAB3B, Ras-related protein Rab-3B, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3BP20337 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB3BP20337 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB3BP20337 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB3BP20337 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB3BP20337 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB3BP20337 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB3BP20337 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB3BP20337 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB3BP20337 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB3BP20337 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB3BP20337 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB3BP20337 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB3BP20337 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB3BP20337 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAB3BP20337 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAB3BP20337 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAB3BP20337 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAB3BP20337 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAB3BP20337 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB3BP20337 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB3BP20337 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB3BP20337 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB3BP20337 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB3BP20337 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB3BP20337 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB3BP20337 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB3BP20337 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB3BP20337 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB3BP20337 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB3BP20337 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB3BP20337 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB3BP20337 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB3BP20337 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB3BP20337 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB3BP20337 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB3BP20337 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB3BP20337 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB3BP20337 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB3BP20337 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB3BP20337 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB3BP20337 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB3BP20337 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB3BP20337 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB3BP20337 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB3BP20337 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB3BP20337 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB3BP20337 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB3BP20337 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB3BP20337 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB3BP20337 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB3BP20337 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB3BP20337 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB3BP20337 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB3BP20337 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB3BP20337 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB3BP20337 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB3BP20337 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB3BP20337 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB3BP20337 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB3BP20337 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB3BP20337 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB3BP20337 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB3BP20337 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB3BP20337 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB3BP20337 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB3BP20337 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB3BP20337 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB3BP20337 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB3BP20337 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB3BP20337 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB3BP20337 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB3BP20337 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB3BP20337 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB3BP20337 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB3BP20337 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB3BP20337 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB3BP20337 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB3BP20337 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB3BP20337 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB3BP20337 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB3BP20337 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB3BP20337 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB3BP20337 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB3BP20337 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB3BP20337 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB3BP20337 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB3BP20337 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RAB3BP20337 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB3BP20337 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB3BP20337 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB3BP20337 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB3BP20337 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB3BP20337 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB3BP20337 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB3BP20337 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB3BP20337 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB3BP20337 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB3BP20337 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB3BP20337 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RAB3BP20337 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms