Protein–RNA interactions for Protein: P19338

NCL, Nucleolin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCLP19338 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NCLP19338 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NCLP19338 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NCLP19338 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NCLP19338 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NCLP19338 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NCLP19338 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NCLP19338 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NCLP19338 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NCLP19338 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NCLP19338 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NCLP19338 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NCLP19338 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NCLP19338 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NCLP19338 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NCLP19338 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NCLP19338 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NCLP19338 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NCLP19338 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NCLP19338 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NCLP19338 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NCLP19338 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NCLP19338 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NCLP19338 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NCLP19338 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NCLP19338 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NCLP19338 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NCLP19338 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NCLP19338 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NCLP19338 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NCLP19338 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NCLP19338 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NCLP19338 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NCLP19338 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NCLP19338 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NCLP19338 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NCLP19338 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NCLP19338 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NCLP19338 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NCLP19338 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NCLP19338 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NCLP19338 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NCLP19338 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NCLP19338 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NCLP19338 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NCLP19338 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NCLP19338 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NCLP19338 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NCLP19338 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NCLP19338 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NCLP19338 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NCLP19338 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NCLP19338 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NCLP19338 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NCLP19338 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
NCLP19338 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NCLP19338 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NCLP19338 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NCLP19338 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NCLP19338 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NCLP19338 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NCLP19338 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NCLP19338 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NCLP19338 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NCLP19338 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NCLP19338 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NCLP19338 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NCLP19338 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NCLP19338 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NCLP19338 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NCLP19338 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NCLP19338 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NCLP19338 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NCLP19338 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NCLP19338 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NCLP19338 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NCLP19338 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NCLP19338 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NCLP19338 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NCLP19338 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NCLP19338 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NCLP19338 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NCLP19338 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NCLP19338 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NCLP19338 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NCLP19338 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NCLP19338 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NCLP19338 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NCLP19338 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NCLP19338 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NCLP19338 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NCLP19338 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NCLP19338 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NCLP19338 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NCLP19338 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NCLP19338 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NCLP19338 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NCLP19338 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NCLP19338 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NCLP19338 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms