Protein–RNA interactions for Protein: P17301

ITGA2, Integrin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA2P17301 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ITGA2P17301 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ITGA2P17301 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ITGA2P17301 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ITGA2P17301 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ITGA2P17301 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ITGA2P17301 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ITGA2P17301 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ITGA2P17301 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ITGA2P17301 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ITGA2P17301 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ITGA2P17301 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
ITGA2P17301 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ITGA2P17301 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ITGA2P17301 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ITGA2P17301 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ITGA2P17301 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ITGA2P17301 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ITGA2P17301 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ITGA2P17301 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ITGA2P17301 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ITGA2P17301 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ITGA2P17301 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ITGA2P17301 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ITGA2P17301 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ITGA2P17301 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ITGA2P17301 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ITGA2P17301 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ITGA2P17301 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ITGA2P17301 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ITGA2P17301 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ITGA2P17301 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ITGA2P17301 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ITGA2P17301 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ITGA2P17301 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ITGA2P17301 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGA2P17301 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGA2P17301 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGA2P17301 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGA2P17301 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGA2P17301 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGA2P17301 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGA2P17301 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGA2P17301 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGA2P17301 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGA2P17301 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGA2P17301 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGA2P17301 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGA2P17301 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGA2P17301 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGA2P17301 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGA2P17301 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGA2P17301 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGA2P17301 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGA2P17301 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGA2P17301 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGA2P17301 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGA2P17301 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGA2P17301 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGA2P17301 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGA2P17301 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGA2P17301 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGA2P17301 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGA2P17301 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGA2P17301 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGA2P17301 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGA2P17301 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGA2P17301 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGA2P17301 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGA2P17301 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGA2P17301 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGA2P17301 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGA2P17301 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGA2P17301 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGA2P17301 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGA2P17301 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGA2P17301 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGA2P17301 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGA2P17301 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGA2P17301 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGA2P17301 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGA2P17301 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGA2P17301 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGA2P17301 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGA2P17301 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGA2P17301 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGA2P17301 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGA2P17301 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGA2P17301 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGA2P17301 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGA2P17301 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGA2P17301 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGA2P17301 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGA2P17301 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGA2P17301 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGA2P17301 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGA2P17301 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGA2P17301 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGA2P17301 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGA2P17301 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms