Protein–RNA interactions for Protein: P17036

ZNF3, Zinc finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF3P17036 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ZNF3P17036 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ZNF3P17036 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ZNF3P17036 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ZNF3P17036 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ZNF3P17036 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ZNF3P17036 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ZNF3P17036 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ZNF3P17036 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ZNF3P17036 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ZNF3P17036 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ZNF3P17036 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ZNF3P17036 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
ZNF3P17036 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ZNF3P17036 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ZNF3P17036 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ZNF3P17036 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ZNF3P17036 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ZNF3P17036 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ZNF3P17036 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ZNF3P17036 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ZNF3P17036 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ZNF3P17036 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ZNF3P17036 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ZNF3P17036 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ZNF3P17036 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZNF3P17036 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZNF3P17036 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZNF3P17036 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZNF3P17036 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZNF3P17036 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZNF3P17036 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZNF3P17036 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZNF3P17036 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZNF3P17036 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZNF3P17036 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZNF3P17036 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ZNF3P17036 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZNF3P17036 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZNF3P17036 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZNF3P17036 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZNF3P17036 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZNF3P17036 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZNF3P17036 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZNF3P17036 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZNF3P17036 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZNF3P17036 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZNF3P17036 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZNF3P17036 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNF3P17036 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNF3P17036 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNF3P17036 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNF3P17036 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNF3P17036 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNF3P17036 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNF3P17036 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNF3P17036 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNF3P17036 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNF3P17036 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNF3P17036 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNF3P17036 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNF3P17036 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNF3P17036 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNF3P17036 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNF3P17036 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNF3P17036 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNF3P17036 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNF3P17036 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNF3P17036 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNF3P17036 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNF3P17036 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF3P17036 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF3P17036 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF3P17036 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF3P17036 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF3P17036 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF3P17036 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF3P17036 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF3P17036 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF3P17036 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF3P17036 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF3P17036 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF3P17036 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF3P17036 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF3P17036 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF3P17036 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF3P17036 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF3P17036 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF3P17036 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF3P17036 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF3P17036 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF3P17036 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF3P17036 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF3P17036 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF3P17036 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF3P17036 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF3P17036 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF3P17036 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF3P17036 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF3P17036 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms