Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTLA4P16410 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CTLA4P16410 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTLA4P16410 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTLA4P16410 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTLA4P16410 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTLA4P16410 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTLA4P16410 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTLA4P16410 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTLA4P16410 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTLA4P16410 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTLA4P16410 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTLA4P16410 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTLA4P16410 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTLA4P16410 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTLA4P16410 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTLA4P16410 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTLA4P16410 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTLA4P16410 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTLA4P16410 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTLA4P16410 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTLA4P16410 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTLA4P16410 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTLA4P16410 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTLA4P16410 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTLA4P16410 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTLA4P16410 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTLA4P16410 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTLA4P16410 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTLA4P16410 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CTLA4P16410 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTLA4P16410 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTLA4P16410 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTLA4P16410 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTLA4P16410 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTLA4P16410 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTLA4P16410 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTLA4P16410 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTLA4P16410 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CTLA4P16410 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CTLA4P16410 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CTLA4P16410 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CTLA4P16410 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CTLA4P16410 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CTLA4P16410 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CTLA4P16410 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
CTLA4P16410 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CTLA4P16410 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CTLA4P16410 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CTLA4P16410 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
CTLA4P16410 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTLA4P16410 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTLA4P16410 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTLA4P16410 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTLA4P16410 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CTLA4P16410 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTLA4P16410 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTLA4P16410 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTLA4P16410 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTLA4P16410 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTLA4P16410 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTLA4P16410 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTLA4P16410 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTLA4P16410 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTLA4P16410 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTLA4P16410 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTLA4P16410 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTLA4P16410 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTLA4P16410 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTLA4P16410 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTLA4P16410 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTLA4P16410 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTLA4P16410 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTLA4P16410 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTLA4P16410 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTLA4P16410 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTLA4P16410 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTLA4P16410 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTLA4P16410 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTLA4P16410 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTLA4P16410 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTLA4P16410 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTLA4P16410 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTLA4P16410 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTLA4P16410 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTLA4P16410 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTLA4P16410 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CTLA4P16410 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTLA4P16410 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTLA4P16410 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTLA4P16410 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTLA4P16410 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTLA4P16410 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTLA4P16410 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTLA4P16410 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTLA4P16410 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTLA4P16410 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTLA4P16410 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTLA4P16410 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTLA4P16410 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms