Protein–RNA interactions for Protein: P13645

KRT10, Keratin, type I cytoskeletal 10, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT10P13645 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KRT10P13645 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KRT10P13645 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KRT10P13645 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
KRT10P13645 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KRT10P13645 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KRT10P13645 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KRT10P13645 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KRT10P13645 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KRT10P13645 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KRT10P13645 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KRT10P13645 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KRT10P13645 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KRT10P13645 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KRT10P13645 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KRT10P13645 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KRT10P13645 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KRT10P13645 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KRT10P13645 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KRT10P13645 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT10P13645 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT10P13645 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT10P13645 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT10P13645 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT10P13645 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT10P13645 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT10P13645 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT10P13645 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT10P13645 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT10P13645 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT10P13645 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRT10P13645 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRT10P13645 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRT10P13645 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRT10P13645 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRT10P13645 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRT10P13645 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRT10P13645 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRT10P13645 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRT10P13645 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRT10P13645 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRT10P13645 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
KRT10P13645 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRT10P13645 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRT10P13645 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRT10P13645 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRT10P13645 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRT10P13645 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KRT10P13645 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KRT10P13645 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KRT10P13645 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KRT10P13645 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KRT10P13645 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KRT10P13645 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KRT10P13645 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KRT10P13645 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KRT10P13645 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KRT10P13645 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KRT10P13645 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KRT10P13645 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KRT10P13645 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KRT10P13645 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KRT10P13645 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KRT10P13645 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KRT10P13645 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KRT10P13645 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
KRT10P13645 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KRT10P13645 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KRT10P13645 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KRT10P13645 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KRT10P13645 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KRT10P13645 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KRT10P13645 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KRT10P13645 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KRT10P13645 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KRT10P13645 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
KRT10P13645 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KRT10P13645 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KRT10P13645 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KRT10P13645 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KRT10P13645 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KRT10P13645 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KRT10P13645 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KRT10P13645 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KRT10P13645 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KRT10P13645 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KRT10P13645 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KRT10P13645 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KRT10P13645 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KRT10P13645 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KRT10P13645 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KRT10P13645 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KRT10P13645 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
KRT10P13645 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
KRT10P13645 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KRT10P13645 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KRT10P13645 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
KRT10P13645 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KRT10P13645 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KRT10P13645 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms