Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGA4P13612 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGA4P13612 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGA4P13612 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGA4P13612 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGA4P13612 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGA4P13612 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGA4P13612 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGA4P13612 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGA4P13612 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGA4P13612 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGA4P13612 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGA4P13612 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGA4P13612 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ITGA4P13612 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGA4P13612 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGA4P13612 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGA4P13612 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGA4P13612 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGA4P13612 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGA4P13612 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGA4P13612 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGA4P13612 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGA4P13612 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGA4P13612 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGA4P13612 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGA4P13612 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGA4P13612 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGA4P13612 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGA4P13612 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGA4P13612 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGA4P13612 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGA4P13612 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGA4P13612 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGA4P13612 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGA4P13612 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGA4P13612 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGA4P13612 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGA4P13612 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGA4P13612 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGA4P13612 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGA4P13612 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGA4P13612 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGA4P13612 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGA4P13612 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGA4P13612 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGA4P13612 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGA4P13612 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGA4P13612 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGA4P13612 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGA4P13612 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGA4P13612 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGA4P13612 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGA4P13612 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGA4P13612 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGA4P13612 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGA4P13612 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGA4P13612 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGA4P13612 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGA4P13612 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGA4P13612 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGA4P13612 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGA4P13612 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGA4P13612 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGA4P13612 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGA4P13612 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGA4P13612 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGA4P13612 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGA4P13612 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGA4P13612 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGA4P13612 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGA4P13612 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGA4P13612 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGA4P13612 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGA4P13612 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGA4P13612 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGA4P13612 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGA4P13612 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGA4P13612 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGA4P13612 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGA4P13612 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGA4P13612 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGA4P13612 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGA4P13612 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGA4P13612 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGA4P13612 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGA4P13612 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGA4P13612 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGA4P13612 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGA4P13612 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGA4P13612 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGA4P13612 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGA4P13612 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGA4P13612 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGA4P13612 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGA4P13612 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGA4P13612 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGA4P13612 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ITGA4P13612 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ITGA4P13612 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.8 ms