Protein–RNA interactions for Protein: P11229

CHRM1, Muscarinic acetylcholine receptor M1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRM1P11229 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHRM1P11229 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHRM1P11229 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHRM1P11229 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHRM1P11229 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CHRM1P11229 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CHRM1P11229 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CHRM1P11229 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CHRM1P11229 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHRM1P11229 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHRM1P11229 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHRM1P11229 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHRM1P11229 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHRM1P11229 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHRM1P11229 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHRM1P11229 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHRM1P11229 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHRM1P11229 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHRM1P11229 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHRM1P11229 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHRM1P11229 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHRM1P11229 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHRM1P11229 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHRM1P11229 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHRM1P11229 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHRM1P11229 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHRM1P11229 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHRM1P11229 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHRM1P11229 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHRM1P11229 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHRM1P11229 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHRM1P11229 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHRM1P11229 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHRM1P11229 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHRM1P11229 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CHRM1P11229 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHRM1P11229 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHRM1P11229 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHRM1P11229 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHRM1P11229 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHRM1P11229 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHRM1P11229 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHRM1P11229 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHRM1P11229 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHRM1P11229 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHRM1P11229 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHRM1P11229 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHRM1P11229 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHRM1P11229 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHRM1P11229 RN7SL602P-201ENST00000578326 324 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CHRM1P11229 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHRM1P11229 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHRM1P11229 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHRM1P11229 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHRM1P11229 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHRM1P11229 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHRM1P11229 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHRM1P11229 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHRM1P11229 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHRM1P11229 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHRM1P11229 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHRM1P11229 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHRM1P11229 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHRM1P11229 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHRM1P11229 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHRM1P11229 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHRM1P11229 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHRM1P11229 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHRM1P11229 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHRM1P11229 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHRM1P11229 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHRM1P11229 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CHRM1P11229 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHRM1P11229 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHRM1P11229 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHRM1P11229 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CHRM1P11229 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHRM1P11229 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHRM1P11229 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHRM1P11229 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHRM1P11229 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHRM1P11229 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHRM1P11229 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHRM1P11229 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHRM1P11229 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHRM1P11229 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHRM1P11229 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHRM1P11229 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHRM1P11229 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHRM1P11229 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHRM1P11229 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CHRM1P11229 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHRM1P11229 IL12A-202ENST00000466512 1283 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHRM1P11229 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHRM1P11229 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHRM1P11229 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHRM1P11229 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHRM1P11229 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHRM1P11229 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHRM1P11229 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms