Protein–RNA interactions for Protein: P10589

NR2F1, COUP transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2F1P10589 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NR2F1P10589 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NR2F1P10589 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NR2F1P10589 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NR2F1P10589 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NR2F1P10589 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NR2F1P10589 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NR2F1P10589 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NR2F1P10589 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
NR2F1P10589 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NR2F1P10589 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NR2F1P10589 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NR2F1P10589 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NR2F1P10589 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NR2F1P10589 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NR2F1P10589 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NR2F1P10589 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NR2F1P10589 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NR2F1P10589 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NR2F1P10589 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NR2F1P10589 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NR2F1P10589 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NR2F1P10589 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NR2F1P10589 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NR2F1P10589 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NR2F1P10589 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NR2F1P10589 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NR2F1P10589 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NR2F1P10589 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NR2F1P10589 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NR2F1P10589 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NR2F1P10589 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NR2F1P10589 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NR2F1P10589 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NR2F1P10589 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NR2F1P10589 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NR2F1P10589 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NR2F1P10589 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NR2F1P10589 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NR2F1P10589 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NR2F1P10589 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NR2F1P10589 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NR2F1P10589 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NR2F1P10589 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NR2F1P10589 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NR2F1P10589 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NR2F1P10589 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NR2F1P10589 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NR2F1P10589 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NR2F1P10589 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NR2F1P10589 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NR2F1P10589 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NR2F1P10589 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NR2F1P10589 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NR2F1P10589 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
NR2F1P10589 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NR2F1P10589 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NR2F1P10589 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NR2F1P10589 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NR2F1P10589 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NR2F1P10589 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NR2F1P10589 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NR2F1P10589 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NR2F1P10589 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NR2F1P10589 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
NR2F1P10589 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NR2F1P10589 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NR2F1P10589 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NR2F1P10589 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NR2F1P10589 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NR2F1P10589 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NR2F1P10589 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NR2F1P10589 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NR2F1P10589 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NR2F1P10589 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NR2F1P10589 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NR2F1P10589 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NR2F1P10589 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
NR2F1P10589 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NR2F1P10589 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NR2F1P10589 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NR2F1P10589 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NR2F1P10589 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NR2F1P10589 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NR2F1P10589 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NR2F1P10589 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NR2F1P10589 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NR2F1P10589 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
NR2F1P10589 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
NR2F1P10589 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NR2F1P10589 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NR2F1P10589 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NR2F1P10589 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NR2F1P10589 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
NR2F1P10589 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NR2F1P10589 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NR2F1P10589 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NR2F1P10589 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NR2F1P10589 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NR2F1P10589 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms