Protein–RNA interactions for Protein: P0DN76

U2AF1L5, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit-like protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF1L5P0DN76 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
U2AF1L5P0DN76 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
U2AF1L5P0DN76 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
U2AF1L5P0DN76 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC27.52■■■□□ 2
U2AF1L5P0DN76 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
U2AF1L5P0DN76 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
U2AF1L5P0DN76 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
U2AF1L5P0DN76 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
U2AF1L5P0DN76 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
U2AF1L5P0DN76 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC27.52■■■□□ 2
U2AF1L5P0DN76 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
U2AF1L5P0DN76 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
U2AF1L5P0DN76 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
U2AF1L5P0DN76 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
U2AF1L5P0DN76 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
U2AF1L5P0DN76 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
U2AF1L5P0DN76 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
U2AF1L5P0DN76 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
U2AF1L5P0DN76 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
U2AF1L5P0DN76 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
U2AF1L5P0DN76 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
U2AF1L5P0DN76 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
U2AF1L5P0DN76 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
U2AF1L5P0DN76 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
U2AF1L5P0DN76 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
U2AF1L5P0DN76 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
U2AF1L5P0DN76 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
U2AF1L5P0DN76 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
U2AF1L5P0DN76 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
U2AF1L5P0DN76 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
U2AF1L5P0DN76 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
U2AF1L5P0DN76 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
U2AF1L5P0DN76 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
U2AF1L5P0DN76 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
U2AF1L5P0DN76 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
U2AF1L5P0DN76 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
U2AF1L5P0DN76 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
U2AF1L5P0DN76 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
U2AF1L5P0DN76 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
U2AF1L5P0DN76 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
U2AF1L5P0DN76 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
U2AF1L5P0DN76 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
U2AF1L5P0DN76 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
U2AF1L5P0DN76 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
U2AF1L5P0DN76 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
U2AF1L5P0DN76 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
U2AF1L5P0DN76 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
U2AF1L5P0DN76 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
U2AF1L5P0DN76 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
U2AF1L5P0DN76 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
U2AF1L5P0DN76 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
U2AF1L5P0DN76 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
U2AF1L5P0DN76 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
U2AF1L5P0DN76 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
U2AF1L5P0DN76 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
U2AF1L5P0DN76 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
U2AF1L5P0DN76 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
U2AF1L5P0DN76 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
U2AF1L5P0DN76 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
U2AF1L5P0DN76 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
U2AF1L5P0DN76 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
U2AF1L5P0DN76 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
U2AF1L5P0DN76 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
U2AF1L5P0DN76 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
U2AF1L5P0DN76 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
U2AF1L5P0DN76 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
U2AF1L5P0DN76 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
U2AF1L5P0DN76 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
U2AF1L5P0DN76 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
U2AF1L5P0DN76 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
U2AF1L5P0DN76 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
U2AF1L5P0DN76 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
U2AF1L5P0DN76 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
U2AF1L5P0DN76 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
U2AF1L5P0DN76 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
U2AF1L5P0DN76 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
U2AF1L5P0DN76 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
U2AF1L5P0DN76 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
U2AF1L5P0DN76 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
U2AF1L5P0DN76 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
U2AF1L5P0DN76 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
U2AF1L5P0DN76 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
U2AF1L5P0DN76 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
U2AF1L5P0DN76 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
U2AF1L5P0DN76 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
U2AF1L5P0DN76 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
U2AF1L5P0DN76 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
U2AF1L5P0DN76 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
U2AF1L5P0DN76 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
U2AF1L5P0DN76 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
U2AF1L5P0DN76 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
U2AF1L5P0DN76 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
U2AF1L5P0DN76 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
U2AF1L5P0DN76 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
U2AF1L5P0DN76 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
U2AF1L5P0DN76 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
U2AF1L5P0DN76 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
U2AF1L5P0DN76 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
U2AF1L5P0DN76 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
U2AF1L5P0DN76 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms