Protein–RNA interactions for Protein: P0C843

LINC00032, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00032, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00032P0C843 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LINC00032P0C843 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LINC00032P0C843 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LINC00032P0C843 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LINC00032P0C843 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LINC00032P0C843 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LINC00032P0C843 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LINC00032P0C843 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LINC00032P0C843 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LINC00032P0C843 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LINC00032P0C843 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LINC00032P0C843 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LINC00032P0C843 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LINC00032P0C843 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LINC00032P0C843 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LINC00032P0C843 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
LINC00032P0C843 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LINC00032P0C843 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
LINC00032P0C843 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LINC00032P0C843 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LINC00032P0C843 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
LINC00032P0C843 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LINC00032P0C843 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LINC00032P0C843 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LINC00032P0C843 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
LINC00032P0C843 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
LINC00032P0C843 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
LINC00032P0C843 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
LINC00032P0C843 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
LINC00032P0C843 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
LINC00032P0C843 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
LINC00032P0C843 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
LINC00032P0C843 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LINC00032P0C843 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LINC00032P0C843 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LINC00032P0C843 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LINC00032P0C843 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LINC00032P0C843 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
LINC00032P0C843 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LINC00032P0C843 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LINC00032P0C843 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LINC00032P0C843 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LINC00032P0C843 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LINC00032P0C843 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LINC00032P0C843 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LINC00032P0C843 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LINC00032P0C843 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LINC00032P0C843 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LINC00032P0C843 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
LINC00032P0C843 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
LINC00032P0C843 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LINC00032P0C843 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
LINC00032P0C843 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
LINC00032P0C843 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LINC00032P0C843 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
LINC00032P0C843 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LINC00032P0C843 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LINC00032P0C843 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LINC00032P0C843 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LINC00032P0C843 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LINC00032P0C843 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LINC00032P0C843 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LINC00032P0C843 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LINC00032P0C843 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LINC00032P0C843 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LINC00032P0C843 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LINC00032P0C843 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LINC00032P0C843 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LINC00032P0C843 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LINC00032P0C843 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LINC00032P0C843 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LINC00032P0C843 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LINC00032P0C843 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LINC00032P0C843 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
LINC00032P0C843 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LINC00032P0C843 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LINC00032P0C843 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LINC00032P0C843 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LINC00032P0C843 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LINC00032P0C843 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LINC00032P0C843 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LINC00032P0C843 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LINC00032P0C843 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LINC00032P0C843 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LINC00032P0C843 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
LINC00032P0C843 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LINC00032P0C843 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LINC00032P0C843 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
LINC00032P0C843 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LINC00032P0C843 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LINC00032P0C843 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LINC00032P0C843 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LINC00032P0C843 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LINC00032P0C843 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LINC00032P0C843 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LINC00032P0C843 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LINC00032P0C843 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LINC00032P0C843 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LINC00032P0C843 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LINC00032P0C843 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms