Protein–RNA interactions for Protein: P09238

MMP10, Stromelysin-2, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP10P09238 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MMP10P09238 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MMP10P09238 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MMP10P09238 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MMP10P09238 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MMP10P09238 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MMP10P09238 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MMP10P09238 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MMP10P09238 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MMP10P09238 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MMP10P09238 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MMP10P09238 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MMP10P09238 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MMP10P09238 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MMP10P09238 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MMP10P09238 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MMP10P09238 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
MMP10P09238 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MMP10P09238 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MMP10P09238 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
MMP10P09238 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MMP10P09238 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MMP10P09238 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MMP10P09238 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MMP10P09238 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MMP10P09238 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MMP10P09238 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MMP10P09238 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MMP10P09238 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MMP10P09238 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MMP10P09238 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MMP10P09238 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MMP10P09238 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MMP10P09238 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MMP10P09238 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MMP10P09238 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MMP10P09238 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MMP10P09238 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MMP10P09238 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MMP10P09238 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MMP10P09238 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MMP10P09238 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MMP10P09238 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MMP10P09238 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MMP10P09238 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MMP10P09238 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MMP10P09238 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MMP10P09238 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MMP10P09238 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MMP10P09238 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MMP10P09238 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MMP10P09238 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MMP10P09238 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MMP10P09238 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MMP10P09238 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MMP10P09238 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MMP10P09238 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
MMP10P09238 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
MMP10P09238 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
MMP10P09238 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.75
MMP10P09238 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.75
MMP10P09238 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MMP10P09238 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MMP10P09238 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MMP10P09238 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MMP10P09238 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MMP10P09238 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MMP10P09238 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MMP10P09238 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MMP10P09238 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
MMP10P09238 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MMP10P09238 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MMP10P09238 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MMP10P09238 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MMP10P09238 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MMP10P09238 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MMP10P09238 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MMP10P09238 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MMP10P09238 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MMP10P09238 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
MMP10P09238 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MMP10P09238 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MMP10P09238 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MMP10P09238 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MMP10P09238 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
MMP10P09238 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MMP10P09238 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MMP10P09238 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MMP10P09238 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MMP10P09238 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MMP10P09238 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MMP10P09238 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MMP10P09238 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MMP10P09238 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MMP10P09238 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MMP10P09238 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MMP10P09238 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MMP10P09238 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MMP10P09238 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MMP10P09238 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms