Protein–RNA interactions for Protein: P05165

PCCA, Propionyl-CoA carboxylase alpha chain, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCCAP05165 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PCCAP05165 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PCCAP05165 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PCCAP05165 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PCCAP05165 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PCCAP05165 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PCCAP05165 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PCCAP05165 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PCCAP05165 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PCCAP05165 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PCCAP05165 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PCCAP05165 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PCCAP05165 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PCCAP05165 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PCCAP05165 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PCCAP05165 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PCCAP05165 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PCCAP05165 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PCCAP05165 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PCCAP05165 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PCCAP05165 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PCCAP05165 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PCCAP05165 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PCCAP05165 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PCCAP05165 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PCCAP05165 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PCCAP05165 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PCCAP05165 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PCCAP05165 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PCCAP05165 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PCCAP05165 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PCCAP05165 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PCCAP05165 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PCCAP05165 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PCCAP05165 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PCCAP05165 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PCCAP05165 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PCCAP05165 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PCCAP05165 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PCCAP05165 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PCCAP05165 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PCCAP05165 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PCCAP05165 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PCCAP05165 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PCCAP05165 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PCCAP05165 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PCCAP05165 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PCCAP05165 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PCCAP05165 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PCCAP05165 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCCAP05165 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCCAP05165 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCCAP05165 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCCAP05165 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCCAP05165 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCCAP05165 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCCAP05165 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCCAP05165 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCCAP05165 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCCAP05165 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCCAP05165 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCCAP05165 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCCAP05165 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCCAP05165 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCCAP05165 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCCAP05165 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCCAP05165 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCCAP05165 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PCCAP05165 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PCCAP05165 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PCCAP05165 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PCCAP05165 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PCCAP05165 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PCCAP05165 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PCCAP05165 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PCCAP05165 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PCCAP05165 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PCCAP05165 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PCCAP05165 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PCCAP05165 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PCCAP05165 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PCCAP05165 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PCCAP05165 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PCCAP05165 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PCCAP05165 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PCCAP05165 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PCCAP05165 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PCCAP05165 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PCCAP05165 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PCCAP05165 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PCCAP05165 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PCCAP05165 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PCCAP05165 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PCCAP05165 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PCCAP05165 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PCCAP05165 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PCCAP05165 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PCCAP05165 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PCCAP05165 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PCCAP05165 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms