Protein–RNA interactions for Protein: P04818

TYMS, Thymidylate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYMSP04818 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TYMSP04818 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TYMSP04818 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TYMSP04818 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TYMSP04818 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TYMSP04818 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TYMSP04818 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TYMSP04818 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TYMSP04818 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TYMSP04818 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TYMSP04818 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TYMSP04818 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TYMSP04818 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TYMSP04818 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TYMSP04818 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TYMSP04818 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TYMSP04818 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TYMSP04818 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TYMSP04818 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TYMSP04818 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TYMSP04818 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TYMSP04818 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TYMSP04818 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TYMSP04818 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TYMSP04818 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TYMSP04818 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TYMSP04818 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TYMSP04818 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TYMSP04818 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TYMSP04818 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TYMSP04818 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TYMSP04818 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TYMSP04818 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TYMSP04818 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TYMSP04818 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TYMSP04818 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TYMSP04818 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TYMSP04818 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TYMSP04818 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TYMSP04818 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TYMSP04818 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TYMSP04818 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TYMSP04818 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TYMSP04818 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TYMSP04818 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TYMSP04818 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TYMSP04818 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TYMSP04818 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TYMSP04818 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TYMSP04818 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TYMSP04818 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TYMSP04818 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TYMSP04818 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TYMSP04818 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TYMSP04818 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TYMSP04818 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TYMSP04818 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TYMSP04818 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TYMSP04818 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TYMSP04818 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TYMSP04818 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TYMSP04818 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TYMSP04818 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TYMSP04818 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TYMSP04818 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TYMSP04818 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TYMSP04818 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TYMSP04818 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TYMSP04818 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TYMSP04818 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TYMSP04818 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TYMSP04818 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TYMSP04818 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TYMSP04818 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TYMSP04818 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TYMSP04818 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TYMSP04818 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TYMSP04818 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TYMSP04818 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TYMSP04818 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TYMSP04818 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TYMSP04818 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TYMSP04818 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TYMSP04818 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TYMSP04818 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TYMSP04818 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TYMSP04818 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TYMSP04818 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TYMSP04818 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TYMSP04818 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TYMSP04818 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TYMSP04818 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TYMSP04818 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TYMSP04818 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TYMSP04818 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TYMSP04818 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TYMSP04818 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TYMSP04818 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TYMSP04818 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TYMSP04818 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms