Protein–RNA interactions for Protein: P01733

TRBV12-3, T-cell receptor beta chain V region YT35, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV12-3P01733 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRBV12-3P01733 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRBV12-3P01733 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRBV12-3P01733 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRBV12-3P01733 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRBV12-3P01733 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRBV12-3P01733 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRBV12-3P01733 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRBV12-3P01733 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRBV12-3P01733 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRBV12-3P01733 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRBV12-3P01733 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRBV12-3P01733 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRBV12-3P01733 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRBV12-3P01733 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRBV12-3P01733 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRBV12-3P01733 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRBV12-3P01733 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRBV12-3P01733 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRBV12-3P01733 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRBV12-3P01733 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRBV12-3P01733 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRBV12-3P01733 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRBV12-3P01733 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRBV12-3P01733 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRBV12-3P01733 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRBV12-3P01733 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRBV12-3P01733 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRBV12-3P01733 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TRBV12-3P01733 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRBV12-3P01733 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRBV12-3P01733 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRBV12-3P01733 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRBV12-3P01733 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRBV12-3P01733 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRBV12-3P01733 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRBV12-3P01733 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRBV12-3P01733 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRBV12-3P01733 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRBV12-3P01733 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRBV12-3P01733 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRBV12-3P01733 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRBV12-3P01733 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TRBV12-3P01733 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRBV12-3P01733 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRBV12-3P01733 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRBV12-3P01733 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRBV12-3P01733 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRBV12-3P01733 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRBV12-3P01733 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRBV12-3P01733 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRBV12-3P01733 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRBV12-3P01733 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRBV12-3P01733 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRBV12-3P01733 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRBV12-3P01733 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRBV12-3P01733 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TRBV12-3P01733 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRBV12-3P01733 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRBV12-3P01733 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRBV12-3P01733 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRBV12-3P01733 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRBV12-3P01733 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRBV12-3P01733 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRBV12-3P01733 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRBV12-3P01733 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TRBV12-3P01733 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRBV12-3P01733 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRBV12-3P01733 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRBV12-3P01733 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRBV12-3P01733 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRBV12-3P01733 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRBV12-3P01733 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRBV12-3P01733 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRBV12-3P01733 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRBV12-3P01733 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRBV12-3P01733 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRBV12-3P01733 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRBV12-3P01733 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRBV12-3P01733 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRBV12-3P01733 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRBV12-3P01733 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TRBV12-3P01733 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRBV12-3P01733 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRBV12-3P01733 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRBV12-3P01733 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRBV12-3P01733 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRBV12-3P01733 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TRBV12-3P01733 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRBV12-3P01733 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRBV12-3P01733 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRBV12-3P01733 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRBV12-3P01733 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TRBV12-3P01733 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRBV12-3P01733 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRBV12-3P01733 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRBV12-3P01733 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRBV12-3P01733 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRBV12-3P01733 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRBV12-3P01733 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms