Protein–RNA interactions for Protein: P01562

IFNA1, Interferon alpha-1/13, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA1P01562 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNA1P01562 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNA1P01562 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNA1P01562 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNA1P01562 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNA1P01562 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNA1P01562 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNA1P01562 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNA1P01562 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNA1P01562 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNA1P01562 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNA1P01562 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNA1P01562 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNA1P01562 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNA1P01562 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNA1P01562 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNA1P01562 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNA1P01562 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNA1P01562 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNA1P01562 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNA1P01562 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNA1P01562 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNA1P01562 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNA1P01562 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNA1P01562 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNA1P01562 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNA1P01562 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNA1P01562 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNA1P01562 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNA1P01562 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNA1P01562 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNA1P01562 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNA1P01562 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNA1P01562 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNA1P01562 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNA1P01562 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNA1P01562 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNA1P01562 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNA1P01562 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNA1P01562 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNA1P01562 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFNA1P01562 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFNA1P01562 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFNA1P01562 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFNA1P01562 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFNA1P01562 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFNA1P01562 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFNA1P01562 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFNA1P01562 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFNA1P01562 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFNA1P01562 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
IFNA1P01562 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFNA1P01562 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFNA1P01562 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFNA1P01562 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFNA1P01562 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFNA1P01562 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFNA1P01562 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFNA1P01562 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFNA1P01562 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFNA1P01562 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFNA1P01562 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFNA1P01562 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFNA1P01562 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFNA1P01562 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFNA1P01562 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFNA1P01562 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFNA1P01562 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFNA1P01562 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFNA1P01562 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFNA1P01562 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFNA1P01562 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFNA1P01562 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFNA1P01562 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFNA1P01562 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
IFNA1P01562 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFNA1P01562 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFNA1P01562 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFNA1P01562 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFNA1P01562 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFNA1P01562 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFNA1P01562 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IFNA1P01562 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
IFNA1P01562 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFNA1P01562 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFNA1P01562 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFNA1P01562 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFNA1P01562 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFNA1P01562 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
IFNA1P01562 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFNA1P01562 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFNA1P01562 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFNA1P01562 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFNA1P01562 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFNA1P01562 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFNA1P01562 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFNA1P01562 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFNA1P01562 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFNA1P01562 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFNA1P01562 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms