Protein–RNA interactions for Protein: P01189

POMC, Pro-opiomelanocortin, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POMCP01189 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POMCP01189 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POMCP01189 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POMCP01189 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POMCP01189 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POMCP01189 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POMCP01189 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POMCP01189 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POMCP01189 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
POMCP01189 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
POMCP01189 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POMCP01189 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POMCP01189 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POMCP01189 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POMCP01189 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POMCP01189 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
POMCP01189 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POMCP01189 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POMCP01189 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POMCP01189 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POMCP01189 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POMCP01189 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POMCP01189 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POMCP01189 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POMCP01189 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POMCP01189 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POMCP01189 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POMCP01189 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POMCP01189 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POMCP01189 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POMCP01189 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POMCP01189 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POMCP01189 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POMCP01189 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POMCP01189 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POMCP01189 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
POMCP01189 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
POMCP01189 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
POMCP01189 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POMCP01189 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POMCP01189 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POMCP01189 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POMCP01189 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POMCP01189 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POMCP01189 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POMCP01189 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POMCP01189 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POMCP01189 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POMCP01189 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
POMCP01189 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POMCP01189 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POMCP01189 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POMCP01189 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POMCP01189 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POMCP01189 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POMCP01189 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POMCP01189 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POMCP01189 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POMCP01189 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POMCP01189 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POMCP01189 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POMCP01189 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
POMCP01189 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POMCP01189 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POMCP01189 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POMCP01189 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POMCP01189 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POMCP01189 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POMCP01189 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POMCP01189 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POMCP01189 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POMCP01189 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POMCP01189 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POMCP01189 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POMCP01189 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POMCP01189 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POMCP01189 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POMCP01189 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POMCP01189 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POMCP01189 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POMCP01189 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POMCP01189 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POMCP01189 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POMCP01189 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POMCP01189 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POMCP01189 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
POMCP01189 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POMCP01189 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POMCP01189 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
POMCP01189 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
POMCP01189 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POMCP01189 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POMCP01189 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POMCP01189 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POMCP01189 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POMCP01189 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POMCP01189 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POMCP01189 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POMCP01189 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POMCP01189 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms