Protein–RNA interactions for Protein: O95696

BRD1, Bromodomain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD1O95696 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRD1O95696 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRD1O95696 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRD1O95696 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRD1O95696 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRD1O95696 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRD1O95696 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
BRD1O95696 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRD1O95696 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRD1O95696 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRD1O95696 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRD1O95696 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRD1O95696 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRD1O95696 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRD1O95696 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRD1O95696 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRD1O95696 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRD1O95696 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRD1O95696 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRD1O95696 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRD1O95696 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
BRD1O95696 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRD1O95696 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRD1O95696 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BRD1O95696 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BRD1O95696 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BRD1O95696 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BRD1O95696 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BRD1O95696 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BRD1O95696 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BRD1O95696 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BRD1O95696 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BRD1O95696 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BRD1O95696 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BRD1O95696 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
BRD1O95696 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BRD1O95696 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BRD1O95696 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BRD1O95696 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BRD1O95696 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BRD1O95696 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BRD1O95696 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BRD1O95696 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BRD1O95696 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BRD1O95696 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BRD1O95696 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BRD1O95696 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BRD1O95696 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BRD1O95696 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BRD1O95696 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BRD1O95696 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BRD1O95696 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BRD1O95696 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BRD1O95696 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
BRD1O95696 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
BRD1O95696 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
BRD1O95696 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BRD1O95696 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BRD1O95696 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BRD1O95696 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BRD1O95696 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BRD1O95696 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BRD1O95696 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BRD1O95696 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BRD1O95696 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BRD1O95696 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BRD1O95696 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BRD1O95696 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BRD1O95696 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BRD1O95696 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BRD1O95696 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BRD1O95696 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BRD1O95696 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRD1O95696 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRD1O95696 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRD1O95696 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRD1O95696 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRD1O95696 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRD1O95696 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRD1O95696 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRD1O95696 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRD1O95696 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRD1O95696 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRD1O95696 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRD1O95696 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRD1O95696 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRD1O95696 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRD1O95696 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRD1O95696 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
BRD1O95696 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRD1O95696 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
BRD1O95696 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRD1O95696 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRD1O95696 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRD1O95696 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRD1O95696 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRD1O95696 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRD1O95696 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRD1O95696 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRD1O95696 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms