Protein–RNA interactions for Protein: O95239

KIF4A, Chromosome-associated kinesin KIF4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF4AO95239 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KIF4AO95239 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KIF4AO95239 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KIF4AO95239 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KIF4AO95239 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KIF4AO95239 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KIF4AO95239 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KIF4AO95239 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KIF4AO95239 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KIF4AO95239 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
KIF4AO95239 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KIF4AO95239 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KIF4AO95239 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KIF4AO95239 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KIF4AO95239 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KIF4AO95239 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KIF4AO95239 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KIF4AO95239 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
KIF4AO95239 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
KIF4AO95239 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KIF4AO95239 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
KIF4AO95239 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
KIF4AO95239 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KIF4AO95239 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
KIF4AO95239 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KIF4AO95239 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KIF4AO95239 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KIF4AO95239 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
KIF4AO95239 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KIF4AO95239 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KIF4AO95239 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KIF4AO95239 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KIF4AO95239 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
KIF4AO95239 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KIF4AO95239 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KIF4AO95239 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KIF4AO95239 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KIF4AO95239 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KIF4AO95239 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KIF4AO95239 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KIF4AO95239 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KIF4AO95239 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KIF4AO95239 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
KIF4AO95239 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KIF4AO95239 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
KIF4AO95239 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KIF4AO95239 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KIF4AO95239 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KIF4AO95239 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KIF4AO95239 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KIF4AO95239 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KIF4AO95239 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KIF4AO95239 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KIF4AO95239 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KIF4AO95239 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KIF4AO95239 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KIF4AO95239 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KIF4AO95239 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KIF4AO95239 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KIF4AO95239 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KIF4AO95239 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KIF4AO95239 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KIF4AO95239 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KIF4AO95239 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KIF4AO95239 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KIF4AO95239 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KIF4AO95239 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KIF4AO95239 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KIF4AO95239 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KIF4AO95239 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KIF4AO95239 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KIF4AO95239 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KIF4AO95239 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KIF4AO95239 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KIF4AO95239 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KIF4AO95239 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KIF4AO95239 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KIF4AO95239 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KIF4AO95239 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KIF4AO95239 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KIF4AO95239 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KIF4AO95239 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KIF4AO95239 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KIF4AO95239 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KIF4AO95239 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KIF4AO95239 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KIF4AO95239 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KIF4AO95239 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KIF4AO95239 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KIF4AO95239 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KIF4AO95239 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
KIF4AO95239 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KIF4AO95239 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
KIF4AO95239 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KIF4AO95239 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KIF4AO95239 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KIF4AO95239 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KIF4AO95239 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KIF4AO95239 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KIF4AO95239 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms