Protein–RNA interactions for Protein: O94898

LRIG2, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,065 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG2O94898 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRIG2O94898 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRIG2O94898 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.32■■□□□ 1
LRIG2O94898 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRIG2O94898 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LRIG2O94898 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
LRIG2O94898 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.32■■□□□ 1
LRIG2O94898 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LRIG2O94898 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LRIG2O94898 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRIG2O94898 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LRIG2O94898 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRIG2O94898 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LRIG2O94898 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRIG2O94898 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LRIG2O94898 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LRIG2O94898 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LRIG2O94898 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRIG2O94898 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LRIG2O94898 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LRIG2O94898 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LRIG2O94898 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
LRIG2O94898 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LRIG2O94898 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LRIG2O94898 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LRIG2O94898 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LRIG2O94898 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LRIG2O94898 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LRIG2O94898 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LRIG2O94898 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LRIG2O94898 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LRIG2O94898 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LRIG2O94898 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LRIG2O94898 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LRIG2O94898 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LRIG2O94898 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LRIG2O94898 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LRIG2O94898 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
LRIG2O94898 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LRIG2O94898 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRIG2O94898 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRIG2O94898 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRIG2O94898 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LRIG2O94898 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRIG2O94898 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRIG2O94898 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LRIG2O94898 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRIG2O94898 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LRIG2O94898 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LRIG2O94898 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRIG2O94898 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LRIG2O94898 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LRIG2O94898 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LRIG2O94898 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRIG2O94898 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRIG2O94898 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRIG2O94898 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LRIG2O94898 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LRIG2O94898 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LRIG2O94898 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRIG2O94898 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LRIG2O94898 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LRIG2O94898 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRIG2O94898 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.29■■□□□ 1
LRIG2O94898 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LRIG2O94898 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.29■■□□□ 1
LRIG2O94898 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.29■■□□□ 1
LRIG2O94898 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.29■■□□□ 1
LRIG2O94898 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.29■■□□□ 1
LRIG2O94898 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LRIG2O94898 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LRIG2O94898 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRIG2O94898 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRIG2O94898 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRIG2O94898 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LRIG2O94898 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRIG2O94898 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LRIG2O94898 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LRIG2O94898 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRIG2O94898 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRIG2O94898 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LRIG2O94898 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRIG2O94898 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LRIG2O94898 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LRIG2O94898 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRIG2O94898 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LRIG2O94898 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LRIG2O94898 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRIG2O94898 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LRIG2O94898 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRIG2O94898 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LRIG2O94898 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LRIG2O94898 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LRIG2O94898 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LRIG2O94898 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LRIG2O94898 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LRIG2O94898 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LRIG2O94898 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LRIG2O94898 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LRIG2O94898 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms